番茄qRT-PCR内参基因的筛选
文献类型: 中文期刊
第一作者: 姜静
作者: 姜静;王银磊;赵丽萍;周蓉;李亚茹;赵统敏;余文贵
作者机构:
关键词: 番茄;实时荧光定量PCR;内参基因
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2017 年 02 期
页码: 389-396
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以高温、低温、盐胁迫、TYLCV接种处理和对照的番茄幼苗为植物材料,通过实时荧光定量RT-PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)方法分析了常用的8个内参基因肌动蛋白基因(ACT)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)、泛素基因(UBI)、18S核糖体RNA基因(18S)、转录延伸因子基因(EF-1a)、β-微管蛋白基因(TUB)、表达蛋白基因(EXP)和接合素蛋白复合物基因(CAC)在不同样本中的表达情况。利用ge Norm和Norm Finder软件分析筛选表达稳定性较高的内参基因。结果表明,在不同胁迫处理条件下,UBI和ACT的稳定性较高;在同样的胁迫处理中,8个内参基因的表达稳定性不同。综合而言,虽然UBI和ACT的稳定性同样较高,但在TYLCV接种处理试验中ACT的稳定性相对较差,而TUB和GAPDH表达较稳定,故TUB和GAPDH可在TYLCV接种处理试验中作为番茄qRT-PCR的内参基因。
分类号: S641.2
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