不同基因型草鱼呼肠孤病毒通用RT-PCR检测方法的建立及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 范玉顶

作者： 范玉顶;马杰;周勇;江南;刘文枝;曾令兵

作者机构：

关键词： 不同基因型草鱼呼肠孤病毒;简并引物;RT-PCR;VP2蛋白;快速检测

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 9-16

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据Gen Bank登录的草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)不同基因型毒株编码VP2蛋白的S2节段保守序列,设计1对简并引物,通过优化反应条件及灵敏度和特异性评价,建立了一种能同时检测三种基因型GCRV的通用RT-PCR检测方法。结果显示:该方法在三种基因型GCRV中均扩增出大小约590 bp的特异性条带;灵敏度试验结果显示,该方法对于I、Ⅱ、Ⅲ型GCRV的检测限分别为380、250和380拷贝/μL。该方法可特异性地检测目前已知的三种基因型GCRV,而在大鲵虹彩病毒(GSIV)、锦鲤疱疹病毒(KHV)、鲤疱疹病毒Ⅱ型(Cy HV-2)、鲤春病毒血症病毒(SVCV)和传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)中无扩增产物。利用该方法检测49份草鱼出血病疑似样品,结果显示均为GCRV阳性,其中I型阳性率为8. 2%,Ⅱ型阳性率为85. 7%,Ⅲ型阳性率为2%,I、Ⅱ型混合感染阳性率为4. 1%,其他类型的混合感染未检测到。结果表明,本研究建立的针对I、Ⅱ和Ⅲ型GCRV的RT-PCR检测方法具有通用性好、省时高效的突出特点,同时还兼具较高的灵敏度和特异性。

分类号： S943

  • 相关文献

[1]不同基因型草鱼呼肠孤病毒通用RT-PCR检测方法的建立及应用. 范玉顶,马杰,周勇,江南,刘文枝,曾令兵. 2018

[2]应用特异引物和简并引物检测百合斑驳病毒. 丁元明,王继华,刘忠善,陆琳. 2004

[3]香石竹坏死斑点病毒的鉴定与检测. 赵珊,王继华,王丽花,杨秀梅. 2010

[4]鹅星状病毒LAMP快速检测方法的建立与应用. 张玉霞,杨金兴,孟凯,蔡李萌,袁小远,王友令. 2019

[5]蓝莓休克病毒的RT-PCR快速检测方法建立. 谢丽雪,蔡伟,郑姗,张立杰,张小艳,李韬. 2015

[6]不同TAIL-PCR通用引物在转基因大豆、水稻、油菜侧翼序列分离中的应用评价. 陈笑芸,汪小福,刘仁虎,张小明,周育,缪青梅,徐俊锋. 2013

[7]冷诱导下毛百合甘油-3-磷酸酰基转移酶活性变化及其基因保守区的克隆. 陈丽静,葛菱,李浩戈,郭志富,张丽,党晓璇,陶承光,李天来. 2011

[8]野生马蔺中和抗性有关基因片段的分离与初步分析. 蔡玉珍,刘丽,王中伟,邢少辰. 2005

[9]简并引物法克隆保加利亚乳杆菌β-N-乙酰氨基己糖苷酶基因. 崔文明,刘鹭,张书文,逄晓阳,李红娟,吕加平. 2013

[10]云南悬钩子蔷薇NBS-LRR类抗病基因同源克隆与分析. 陈玲,张颢,邱显钦,晏慧君,王其刚,蹇洪英,唐开学. 2012

[11]cry1A基因通用检测方法的建立. 董美,胡晓颖,孟丽霞,宛煜嵩,刘卫晓,金芜军,李亮. 2020

[12]葡萄卷叶伴随病毒4和5简并引物和多重PCR检测. 范旭东,董雅凤,张尊平,任芳,裴光前. 2012

[13]冷胁迫下王百合GPAT基因保守区克隆及表达分析. 陈丽静,孙春玉,钟鸣,阮燕晔,明军,雷家军. 2011

[14]田头菇属真菌信息素受体基因保守区克隆及多态性分析. 何莹莹,陈卫民,赵永昌,周德群. 2013

[15]Potyvirus属成员基因组全序列的简并引物PCR和RACE扩增方法. 陈炯,陈剑平. 2002

[16]甘薯WRKY基因家族序列的分离与鉴定. 王连军,雷剑,苏文瑾,杨新笋. 2013

[17]简并引物法克隆保加利亚乳杆菌β-N-乙酰氨基己糖苷酶基因. 崔文明,刘鹭,张书文,逄晓阳,李红娟,吕加平. 2013

[18]基于NBS-LRR类R基因保守结构域克隆瓠瓜抗病基因同源序列. 赵芹,谢大森,何晓明,罗少波,彭庆务. 2015

[19]桑椹缩小型菌核病菌丝裂原活化蛋白激酶基因Mmk1的克隆与分析. 朱志贤,于翠,李勇,莫荣利,邓文,胡兴明. 2018

[20]抗稻瘟病菌链霉菌JK-1聚酮合酶合成基因的克隆. 张学江,杨立军,曾凡松,龚双军,史文琦. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序