西瓜miR164b靶基因鉴定及其对黄瓜绿斑驳花叶病毒侵染应答的分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙玉燕

作者： 孙玉燕;何艳军;牛晓伟;崔狄;范敏

作者机构：

关键词： 西瓜;miR164;NAC;降解组测序;表达模式

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2018 年 03 期

页码： 482-492

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 将miR164b序列与西瓜基因组进行比对,获得miR164b前体Pre-miR164b基因并克隆。Pre-miR164b长度为97 bp,含有完整的茎环结构。Pre-miR164b启动子区含有光响应元件、赤霉素响应元件、乙烯响应元件、水杨酸响应元件、真菌诱导响应元件等多个顺式作用元件。降解组测序获得miR164b的4个靶基因,均注释为NAC转录因子基因,剪切位点位于miR164b序列5′端第10位碱基。miR164b及靶基因在黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)侵染不同时间的表达模式不同,靶基因Cla018596的表达模式与miR164b呈负相关,而Cla019099、Cla023219和Cla023357的表达模式与miR164b没有相关性。

分类号： S436.5

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