基于重测序鉴定GbTMEM214基因在陆地棉基因组的插入位点

文献类型： 中文期刊

第一作者： 程俊凌

作者： 程俊凌;赵亮;徐剑文;刘剑光;徐鹏;徐珍珍;郭琪;王月平;赵君;沈新莲;陈全家;肖松华

作者机构：

关键词： 转基因棉花;GbTMEM214;重测序;插入位点;侧翼序列

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2024 年 36 卷 004 期

页码： 285-295

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】利用农杆菌介导法获得了转GbTMEM214基因陆地棉品系，旨在明确转基因棉花株系中T-DNA插入位点的序列特征及检测方法，为其生物安全评价提供依据。【方法】基于基因组重测序技术，利用BLASTn将测序数据与陆地棉TM-1基因组序列进行比对分析，设计特异性引物通过聚合酶链式反应（polymerase chain reaction, PCR）验证插入位点。【结果】携带目标基因GbTMEM214的T-DNA整合在陆地棉基因组D13号染色体57 019 068～57 019 106 bp,T-DNA插入导致受体基因组37 bp的片段缺失；通过PCR扩增获得携带Gb TMEM214基因的T-DNA插入位点的侧翼序列，由此建立了转GbTMEM214基因棉花的特异性检测方法。【结论】基于基因组重测序技术获得了转Gb TMEM214基因棉花的T-DNA插入位点及侧翼序列信息，可为转基因棉花的生物安全评价提供技术参考。

分类号： S562

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