6种重要经济鱼类生长激素完整cDNA的克隆和序列分析(英文)
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张竞男
作者: 张竞男;宋平;胡珈瑞;莫赛军;彭茂宇;周伟;邹记兴;胡隐昌
作者机构:
关键词: 生长激素;完整cDNA;序列分析
期刊名称: 遗传学报
ISSN: 0379-4172
年卷期: 2005 年 32 卷 01 期
页码: 19-29
收录情况: SCI ; 北大核心 ; CSCD
摘要: 通过RT PCR、3′ RACE、5′ RACE方法 ,从 6种重要经济鱼类———大眼鳜 (Sinipercakneri)、石斑鱼 (Epinepheluscoioides)、黄鳝 (Monopterusalbus)、鲶鱼 (Silurusasotus)、泥鳅 (Misgurnusanguillicaudatus)和方正银鲫 (CarassiusauratusgibelioBloch ,FangZhengcruciancarp)中克隆了生长激素 (GrowthHormone ,GH)的完整cDNA序列 (除石斑鱼序列外 ,其他生长激素序列均系第一次克隆 ) ,并详细分析了其序列特征。测序结果显示 ,克隆的 6种GHcDNA长度依次为95 3bp、10 2 3bp、82 5bp、10 82bp、115 4bp和 1180bp ,它们均包含一个长度为 6 0 0个左右核苷酸的完整阅读框 ,分别编码一个 2 0 0个左右氨基酸的蛋白 :大眼鳜、石斑鱼和黄鳝GH为 2 0 4个氨基酸 ,鲶鱼GH为 2 0 0个氨基酸 ,泥鳅和方正银鲫GH为 2 10个氨基酸。这 6种蛋白序列与其他已知的鱼类GH序列都有较高的同源性 ,特别是与相同目的鱼类序列相比。通过序列比对 ,在这些蛋白序列内鉴定了许多保守的氨基酸残基 ,其中的大多数聚集而成 5个保守域。基于这 6种鱼类序列的编码区和其他鱼类的GH编码序列进行分子系统学分析 ,结果 (MP和NJ树 )与根据形态特征构建的系统发育树基本一致 ,特别是在硬骨鱼类较大分类阶元 (目间、目以上 )的系统发育研究方面?
分类号: Q751
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