草鱼呼肠孤病毒AH528株全基因组特征及进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴明林

作者： 吴明林;李海洋;江河;何吉祥;侯冠军;蒋阳阳

作者机构：

关键词： 草鱼出血病;草鱼呼肠孤病毒;VP1蛋白;水生呼肠孤病毒

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 36-43

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 草鱼出血病是由草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)引起的严重危害1~2龄草鱼的一种传染性疾病。本研究从安徽合肥地区患典型草鱼出血病的病鱼组织中分离到1株新的GCRV致病株,暂命名为GCRV-AH528。鱼体人工感染实验结果显示,实验鱼出现典型的出血病症状:体背发黑,鳍基部、腹部、口腔、鳃丝、肠道充血发红。全基因组特征分析显示,GCRV-AH528由11个双链RNA节段组成,节段大小在1027~3925 bp之间,AT平均含量为50.2%,GC平均含量为49.8%。与其他GCRVⅡ型毒株相比,L1节段在701~702位置缺少3个核苷酸(TAT),少编码1个酪氨基;M4节段出现突变,含2个开放阅读框,编码2个非结构蛋白NS9和NS69。所有节段两端均含有6 bp保守的末端核苷酸序列5'-GUAAU/CU…UU/GCAUC-3';另除L1、M6节段外,其余9个节段均在编码区两侧发现5~9 bp的颠倒互补序列。GCRV-AH528与其他呼肠孤病毒核苷酸平均相似度在37.1%~98.1%之间;编码蛋白平均相似度在24.3%~98.3%之间。基于VP1蛋白的聚类分析结果显示,该病毒属于水生呼肠孤病毒属,在氨基酸水平上与典型株GCRV-873株的进化关系较远。本研究结果表明,该毒株为一株新的草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型致病株。

分类号： S943

  • 相关文献

[1]草鱼出血病的诊断与防治要点. 曾令兵. 2012

[2]草鱼呼肠孤病毒三重 PCR 检测方法的建立及其应用草鱼呼肠孤病毒三重 PCR 检测方法的建立及其应用. 曾伟伟,王庆,王英英,张乐生,刘宝芹,石存斌,吴淑勤. 2013

[3]草鱼呼肠孤病毒分子生物学研究进展. 李永刚,曾伟伟,王庆,殷亮,王英英,石存斌,吴淑勤. 2013

[4]草鱼呼肠孤病毒三重PCR检测方法的建立及其应用. 曾伟伟,王庆,王英英,张乐生,刘宝芹,石存斌,吴淑勤. 2013

[5]水生呼肠孤病毒基因组研究进展. 殷亮,王庆,曾伟伟,李永刚,王英英,石存斌,吴淑勤. 2013

[6]草鱼呼肠孤病毒VP6蛋白与大肠杆菌LTB亚基植物融合表达载体的构建. 周勇,曾令兵,范玉顶,罗晓松,徐进,肖艺. 2011

[7]草鱼出血病细胞培养灭活疫苗的研究——疫苗株的免疫原性及其有效免疫剂量的比较. 杨先乐,夏春,左文功. 1989

[8]草鱼出血病发生风险半定量评估模型的构建. 杨淞,吴淑勤,李宁求,石存斌,邓国成,林文辉,林强. 2012

[9]草鱼出血病两种免疫途径的对照试验. 江河,戚少燕,陈宇,李艳和. 2002

[10]草鱼出血病细胞疫苗微囊制备与体外释放研究. 李瑞伟,曾令兵,张辉,肖艺,周勇,范玉顶,刘秋凤,孙建滨. 2013

[11]鱼病毒病. 李崇华. 1990

[12]影响草鱼出血病疫苗免疫效果因素风险评估. 李宁求,米彦飞,付小哲,林强,石存斌,邓国成,吴淑勤. 2014

[13]水产病害防治研究领域. 吴淑勤. 2008

[14]草鱼呼肠孤病毒逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法的建立. 张金凤,曾令兵,张辉,周勇,肖艺,苏岚,高正勇. 2013

[15]特异化饵料免疫预防草鱼出血病的效果. 江河,戚少燕,陈宇,卢文轩,管远亮,李艳和. 2001

[16]草鱼♀×鳡♂杂交F_1代的养殖性状分析. 余来宁,夏小平,杨东,姚雁鸿,刘红艳,张繁荣. 2015

[17]草鱼呼肠孤病毒JX-0902株的分离和鉴定. 刘永奎,王庆,曾伟伟,石存斌,张超,陈道印,吴淑勤. 2011

[18]草鱼出血病及其防治技术. 高晓,李兵. 2008

[19]草鱼鳃介导草鱼呼肠孤病毒免疫应答（英文）. 李青梅,陈利军,饶友亮,付小哲,苏建国. 2014

[20]草鱼呼肠孤病毒纤维蛋白VP56与草鱼GRP78蛋白互作诱导内质网应激. 苏航,苏建国. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序