RACE法克隆亚麻COMT基因及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 龙松华

作者: 龙松华;乔瑞清;陈信波;邱财生;邓欣;郭媛;郝冬梅;王玉富

作者机构:

关键词: 亚麻;木质素;COMT基因;RACE;生物信息学分析

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2013 年 0 卷 12 期

页码: 78-83

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用RACE技术克隆得到亚麻木质素合成关键酶基因COMT基因的cDNA全长序列,该基因cDNA全长1 726 bp(GenBank登录号为KC832865)。含有1 104 bp完整的开放阅读框,5'非编码区长423 bp,3'非编码区长199 bp。对序列进行生物信息学分析的结果 :编码的蛋白由367个氨基酸组成(其中亮氨酸38个,丙氨酸32个和丝氨酸28个),相对分子量为40 kD,等电点pI为5.7;蛋白质二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主;构建系统进化树表明与赤桉(Eucalyptus camaldulensis)亲缘关系最近。

分类号: S563.2

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