西藏青稞品种藏青13高氮处理的SSH文库构建及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐齐君

作者： 徐齐君;王玉林;原红军;曾兴权;尼玛扎西

作者机构：

关键词： 青稞;高氮处理;SSH;EST

期刊名称： 大麦与谷类科学

ISSN： 1673-6486

年卷期： 2016 年 33 卷 01 期

页码： 1-7

摘要： 为了分析青稞高氮处理相关基因的表达,以藏青13为实验材料,通过抑制差减杂交构建了青稞高氮处理下的差减c DNA文库。在随机挑取的281个阳性克隆中,测序获得219条高质量的EST,含有212条非重复且与Genbank中的基因或蛋白具有较高的同源性的序列。对其进行Blast2Go功能注释可将差异表达的基因定位到细胞组件、分子功能和代谢过程3大类内。通过KEGG代谢途径分析,212个比对结果中的117个ESTs有详细的KO功能注释,定位到17个具体的代谢途径上,且主要定位在光合作用碳固定途径和氮素代谢途径。此外,分析还发现这些基因主要是编码参与结构和功能代谢合成途径中的一些酶,且参与信号转导、转录调节和光合作用等生理过程,说明这些基因很可能参与到青稞在高氮处理下的抗性反应中。

分类号： S512.3

  • 相关文献

[1]西藏青稞品种喜玛拉雅10号干旱胁迫的SSH文库构建及干旱诱导表达基因分析. 曾兴权,尼玛扎西,于静娟,唐亚伟,韦泽秀,其美旺姆,达瓦顿珠,刘仁建,雄奴塔巴,扎西罗布,高丽云. 2012

[2]利用RNAi研究棉花SSH文库上调表达EST的功能. 尹国,路正营,李世云,韩永亮,张朝军,李付广. 2018

[3]西藏青稞品种喜马拉雅8号低温处理的SSH-cDNA文库构建及分析. 王玉林,徐齐君,原红军,曾兴权,尼玛扎西. 2017

[4]西藏青稞品种甘农大7号白粉菌诱导早期应答基因SSH文库的构建及分析. 徐齐君,王玉林,原红军,曾兴权,尼玛扎西. 2017

[5]蓝塘猪和大白猪消减cDNA文库与差异基因分析. 蔡更元,陈瑶生,李加琪,张豪,王翀. 2011

[6]短枝型苹果SSH文库构建及相关基因表达分析. 宋杨,吴树敬,张艳敏,陈学森. 2013

[7]黄萎病菌诱导下的陆地棉高抗黄萎病品种SSH文库的初步构建. 王升正,齐放军,简桂良. 2009

[8]黄龙病诱导下椪柑SSH文库的构建与分析. 钟云,姜波,易干军,曾继吾,王辉. 2012

[9]SSH技术在畜禽繁殖研究中的新进展. 田勇,卢立志. 2012

[10]番木瓜果皮和种子总RNA提取方法的研究. 王静毅,郑丽珊,冀小蕊,邓柳红,武耀廷. 2006

[11]几种基因差异表达筛选技术在动物发育与繁殖中的最新进展. 肖朝庭,储明星,傅衍. 2006

[12]干旱胁迫下棉花SSH文库构建及其抗旱相关基因分析. 王德龙,叶武威,王俊娟,宋丽艳,樊伟丽,崔宇鹏. 2010

[13]山葡萄‘通化-3’抗寒相关基因SSH文库的构建及分析. 米宝琴,毛娟,申鹏,陈佰鸿,郝燕. 2015

[14]碳酸盐碱度胁迫下凡纳滨对虾基因的差异表达. 么宗利,应成琦,周凯,王慧,来琦芳. 2012

[15]抑制差减杂交(SSH)技术及其在植物基因分离上的应用. 李广存,金黎平,谢开云,屈冬玉. 2004

[16]植物差异表达基因克隆技术及研究进展. 谢伟伟,王凭青,杨青川,刘博,李志中. 2005

[17]激活蛋白处理水稻引发基因差异表达的研究. 杨勇,谢馥交,刘峥,邱德文,杨秀芬. 2006

[18]基于SSH的科研院所科研管理系统设计——以某渔业研究所为例. 刁劭譞,丁玲. 2014

[19]大白菜表达序列标签SSR标记分析. 葛佳,谢华,崔崇士,洪剑明,马荣才. 2005

[20]大叶藻EST-SSR标记开发及其在大叶藻群体遗传多样性研究中的应用. 刘福利,刘坤,王飞久,孙修涛,汪文俊,梁洲瑞,马兴宇. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序