草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱书礼

作者： 朱书礼;李新辉;杨计平;李跃飞;李捷;帅方敏;李琳

作者机构：

关键词： 草鱼;α-淀粉酶基因;Genome Walking;5'侧翼序

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2014 年 05 期

页码： 89-95

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2 063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点(TSS);在TSS上游30 bp处有1个TATA-box,-58 bp处有CCAAT-box;在5'侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。

分类号： Q78`S917.4

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