基于TMT和PRM技术筛选番茄响应盐胁迫差异表达蛋白

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王强

作者： 王强;刘会芳;韩宏伟;庄红梅;王柏柯;王娟;杨涛;王浩;秦勇

作者机构：

关键词： 番茄;盐胁迫;蛋白质组学;TMT;PRM

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2022 年 59 卷 006 期

页码： 1418-1428

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]盐胁迫是造成番茄产量损失和品质严重下降的关键非生物胁迫之一,研究番茄耐盐的分子机制,为认识番茄幼苗应答盐胁迫分子调控机制奠定基础.[方法]研究利用番茄耐盐渐渗系IL-7-5-5和番茄盐敏感M82为试材,采用同位素相对标记与绝对定量(TMT)技术结合定量蛋白质组平行反应监测(PRM)技术,对200 mM盐胁迫12 h的番茄幼苗叶片进行蛋白质组学研究,筛选出盐胁迫响应显著的潜在靶标蛋白.[结果](1)共鉴定出286个差异显著表达蛋白(DEPs).盐胁迫下IL-7-5-5鉴定到191个DEPs,其中119个表达上调,72个表达下调.在M82中鉴定出157个DEPs,其中84个表达上调,73个表达下调.维恩图分析显示,有129和95个差异蛋白分别特异于IL-7-5-5和M82.有62个显著差异蛋白共表达,其中28个在IL-7-5-5和M82中均上调,15个均为下调,表现出对盐胁迫的一致响应.19个显著差异蛋白在表达相反,有5个蛋白质在ST中下调,在SS中上调,14个差异蛋白在ST中上调,在SS中下调;(2)番茄盐反应蛋白种类诱导能力强,主要与代谢过程、单组织过程以及细胞过程有关,细胞组成主要涉及细胞、细胞器、分子复合物和膜,基因本体分子功能显示,这些差异性蛋白主要参与催化活性、绑定和分子功能调控.(3)选择11个显著差异蛋白PRM验证结果与TMT定量表现出相同的趋势.差异蛋白包括A0A3Q7E8T9、A0A3Q7EK65、A0A3Q7FY19、A0A3Q7G430、A0A3Q7ITH0、A0A3Q7J1Y7、P05116、Q43779、A0A3Q7F8W6、A0A3Q7GKU3、A0A3Q7J0Z4,可能是番茄幼苗耐盐的潜在靶标蛋白.[结论]研究采用TMT结合PRM技术,筛选出番茄幼苗响应盐胁迫差异表达蛋白.

分类号： S188%S641.2

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