南方水稻黑条矮缩病苗期抗性的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 农保选

作者： 农保选;秦碧霞;夏秀忠;杨行海;张宗琼;曾宇;刘驰;蔡健和;谢慧婷;崔丽贤;罗群昌;邓国富;刘丕庆;李丹婷

作者机构：

关键词： 南方水稻黑条矮缩病;核心种质;抗性;全基因组关联分析;SNP

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 1069-1079

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 由白背飞虱传播的南方水稻黑条矮缩病(Southern Rice Black-streaked Dwarf Virus, SRBSDV)给水稻的生产造成巨大的产量损失,开展SRBSDV抗性鉴定及全基因组关联分析,可为有效防治水稻SRBSDV提供科学依据。本研究利用人工接种方法,对419份广西地方稻种资源核心种质进行SRBSDV苗期抗性鉴定。结果表明,其SRBSDV苗期发病率变异范围为6.11%～100%,平均值为84.80%,抗性变异系数为23.29%。利用211 818个高质量SNPs对水稻SRBSDV苗期抗性进行全基因组关联分析(GWAS),共检测到10个与水稻SRBSDV苗期抗性显著相关的SNP位点,可解释7.84%～18.30%的表型变异。在所有的显著性关联SNP位点中,共检测到8个抗病基因(R基因),分别位于第1、第5及第11染色体上,可能参与SRBS-DV苗期抗性的调控。本研究结果将为水稻抗SRBSDV分子育种和抗SRBSDV基因克隆提供基础信息。

分类号： S435.111.4

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