赤狐黑色素皮质激素受体-1基因结构特征预测及分子进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋兴超

作者： 宋兴超;杨福合;巴恒星;徐超;鲍坤;邢秀梅;魏海军

作者机构：

关键词： 赤狐;黑色素皮质激素受体-1基因;结构特征;生物信息学

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2013 年 40 卷 01 期

页码： 16-20

收录情况： 北大核心

摘要： 为进一步分析黑色素皮质激素受体-1(melanocortin-1 receptor,MC1R)基因的分子特性,利用生物信息学方法对Gen-Bank中已报道的赤狐MC1R基因完整编码区序列的碱基组成特点及其编码蛋白的结构特征进行了预测及分析,构建了12个物种MC1R蛋白的系统进化树。结果表明,赤狐MC1R基因编码区序列长度为954bp,共编码317个氨基酸,为单一外显子,G+C含量高于A+T,编码的蛋白质是一种分子质量为34.8694ku,等电点为9.13的亲水性稳定碱性蛋白;存在7个强跨膜区、7个广泛磷酸化位点和1个潜在的蛋白激酶C磷酸化位点(第157位的苏氨酸),α-螺旋为其主要二级结构元件;属于G蛋白偶联受体家族一员,包括多个潜在重要功能基序;同源性分析与分子进化树结果均表明,赤狐与北极狐、狗和貉的亲缘关系最近。

分类号： S865.23

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