长距离PCR法扩增RHDV全基因组及其序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张玉颖
作者: 张玉颖;刘光清;倪征;云涛;吴润;张淼涛
作者机构:
关键词: 兔病毒性出血症病;长距离扩增;全基因组
期刊名称: 西北农业学报
ISSN: 1004-1389
年卷期: 2006 年 15 卷 03 期
页码: 1-5
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 从人工感染RHDV致死的兔肝组织中提取病毒总RNA,应用特异性引物将病毒RNA反转录成cD-NA,以此为模板用长距离PCR法扩增RHDV全基因组,将成功扩增出的RHDV全基因组克隆到pMD18-T载体中,经PCR鉴定及酶切分析后进行序列测定。测序结果表明,JX97全基因组由7 437个核苷酸组成,包括由9个核苷酸组成5′NCR、59个核苷酸组成3′NCR和一个至少含有27个核苷酸的poly(A)尾。序列比较结果显示,RHDVJX97株的衣壳蛋白与已报道的参考毒株具有较高的序列同源性,均在90%以上,提示所有的RHDV分离株具有较近的亲缘关系。
分类号: Q78`S852.65
- 相关文献
[1]微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展. 刘晓艳,闵勇,张薇,王开梅,万中义,江爱兵,张光阳,程贤亮,杨自文. 2013
[2]企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析. 施少华,黄瑜,程龙飞,傅光华,陈红梅,陈珍,苏敬良. 2009
[3]国内新型基因2型牛病毒性腹泻病毒研究进展. 张倩,陶洁,张东,区炳明,林航,杨颖,张信军,朱礼倩,王建业,贺生中,孟婷,谢静,朱国强. 2017
[4]草菇全基因组框架图. 鲍大鹏,赵国屏,谭琦,王升跃,陈明杰,郑华军,张劲松,朱永强,汪虹,康慧,陈祥,林楠,冯爱萍. 2010
[5]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016
[6]整合REV LTR的自然重组马立克氏病毒GX0101的全基因组序列分析. 周忠文,苏帅,崔宁,孙鹏,孙淑红,崔治中. 2017
[7]猪的全基因组范围内Fox转录因子家族的识别和进化分析. 宫磊,王志鹏,高会江. 2010
[8]Ⅰ型鸭肝炎病毒A66弱毒株全基因组分子克隆及序列分析. 黄显明,张小飞,魏建忠,李春芬,廖俊伟,毛火云. 2009
[9]Asial型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析. 郑海学,靳野,尚佑军,郭建宏,田宏,杨亚民,刘湘涛,才学鹏. 2010
[10]口蹄疫病毒O型Mya98谱系猪源毒株和牛源毒株全基因组的比较. 吕律,杨帆,何继军,靳野,郭建宏,郑海学,刘湘涛. 2014
[11]黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)的全基因组测序和基因组特征研究. 区又君,温久福,李加儿,梁洪海. 2020
[12]藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析. 时丕彪,王德领,蒋润枝,李斌,晏军,方迪,闫凯旋,顾闽峰. 2022
[13]腺病毒7d基因型与7b基因型全基因组比较分析. 任洛,付扬喜,郑首燕,王鹂鹂,倪科,王莉佳,臧娜,谢晓虹,邓昱,刘恩梅. 2017
[14]木贼镰孢菌D25-1全基因组序列的测定及结构分析. 李雪萍,李建宏,漆永红,郭成,李潇,李敏权. 2019
[15]一株猪捷申病毒全基因组序列测定及分析. 黎少国,张建峰,张春红,沈海燕,刘志成. 2017
[16]苦荞全基因组SSR位点特征分析与分子标记开发. 马名川,刘龙龙,刘璋,周建萍,南成虎,张丽君. 2021
[17]番鸭细小病毒和鸭3型腺病毒的分离鉴定及其全基因组序列分析. 张瑞,陈长福,刘荣昌,程龙飞,傅光华,施少华,陈红梅,万春和,傅秋玲,黄瑜. 2021
[18]“兰箭3号”春箭筈豌豆叶绿体全基因组草图及特征分析. 陶晓丽,马利超,聂斌,王彦荣,刘志鹏. 2017
[19]基于全基因组遗传标记在鉴定绵羊重要经济性状的研究进展. 马丽娜,赵正伟,王锦,马青. 2019
[20]浙江地区猪圆环病毒2型检测及遗传变异分析. 徐丽华,蓝胜芝,余斌,李军星,张鹏超,李宝臣,苏菲,袁秀芳. 2020
作者其他论文 更多>>
-
嵌杯病毒主要衣壳蛋白的研究进展
作者:谈晓梅;徐彦召;刘光清;孟春春
关键词:嵌杯病毒;主要衣壳蛋白;结构;功能
-
铁蛋白与犬α干扰素的融合表达及抗病毒活性检测
作者:宋若楠;刘春草;李航;王真真;贾楠楠;朱杰;李传峰;程松;梁留存;刘光清;王金泉;孟春春
关键词:铁蛋白;犬α干扰素;融合表达;抗病毒活性
-
上海市宠物疫病发生特点及防治建议
作者:王笑;程松;梁留存;汤傲星;孟春春;李传峰;朱杰;刘光清
关键词:宠物;门诊病例;统计分析;传染病
-
慢病毒介导的稳定表达鸭干扰素-γ细胞株的构建
作者:陈柳;倪征;刘可姝;叶伟成;华炯钢;云涛;朱寅初;张存
关键词:鸭干扰素-γ;慢病毒;CHO细胞;稳定表达
-
硒对硼毒害下萝卜幼苗生理特性的影响
作者:袁伟玲;陈卫芳;刘志雄;陈磊夫;吴润
关键词:萝卜;硒;硼毒害;抗氧化酶活性;非酶抗氧化物含量
-
犬腺病毒基因组结构和功能的研究进展
作者:刘禹含;谢军;孟春春;刘光清;巴音查汗·盖力克;李传峰
关键词:犬腺病毒;形态结构;基因组结构;蛋白功能
-
α属冠状病毒入侵宿主所需宿主因子研究进展
作者:孙亚娟;张达;汤傲星;袁莉刚;刘光清;朱杰
关键词:属冠状病毒;功能性受体;辅助因子;入侵机制