莜麦AnHRGP基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘文英

作者： 刘文英;田宏先;王润梅;周凤;刘建霞;刘丽珍

作者机构：

关键词： 莜麦;富含羟基脯氨酸糖蛋白;生物信息学方法;基因序列;氨基酸序列;微观分析;立体结构;基因功能

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2019 年 018 期

页码： 75-78

收录情况： 北大核心

摘要： 以AnHRGP基因编码的富含羟基脯氨酸糖蛋白(AnHRGP)为研究对象,用生物信息学方法对该蛋白质的一级结构及理化性质、跨膜区、亲疏水性、二级结构及功能位点、三级结构特点等进行分析.应用ExPASy在线分析AnHRGP的氨基酸组成及理化性质,通过SOMPA在线预测AnHRGP的二级结构,应用TMHMM Server v. 2.0对AnHRGP进行跨膜结构分析,采用Phyre~2对蛋白质的三级结构进行建模.结果表明,该蛋白基因的开放阅读框(openreadingframe,简称ORF)可以编码202个氨基酸,是一种无信号肽、无跨膜结构、无卷曲螺旋结构、定位于叶绿体和线粒体基质空间的不溶性疏水蛋白.无规则卷曲为AnHRGP中成分最多的二级结构.通过Phyre~2工具模拟出了该蛋白质的三级结构模型.

分类号： S512.6

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