基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 夏丽飞

作者： 夏丽飞;朱兴正;梁名志;马伟;宋维希;田易萍;周萌;陈林波

作者机构：

关键词： 茶树;转录组测序;不育基因;分子标记

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2016 年 29 卷 09 期

页码： 2058-2062

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46 440个含有SSR序列。这些信息为茶树不育基因筛选、不育机理研究以及分子标记开发奠定了基础。

分类号： S571.1

  • 相关文献

[1]油菜核不育两用系不育基因RAPD标记研究初报. 黄团,黄先群,李丽,彭慧元. 2009

[2]茶丽纹象甲为害诱导的茶树防御反应分析. 高香凤,李慧玲,王让剑. 2019

[3]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽,郭桂义. 2019

[4]水培枝条取样法在茶树芽叶转录组测序中的可行性鉴定. 高香凤,王让剑,刘丰静,李慧玲. 2017

[5]基于转录组测序对茶树GST基因表达的研究. 张亚真,韦康,王丽鸳,成浩. 2016

[6]茶饼病诱导感、抗茶树品种的基因表达谱分析. 龙亚芹,冉隆珣,夏丽飞,曲浩,田易萍,陈林波,梁名志. 2021

[7]基于RNA-Seq技术的“紫娟”茶树转录组分析. 陈林波,夏丽飞,周萌,宋维希,李晓霞,焉文光,梁名志. 2015

[8]基于桑树转录组测序的SSR标记开发和引物筛选. 姚刘慧,唐翠明,戴凡炜,王振江,罗国庆. 2015

[9]分子标记技术在茶树研究中的应用. 陈志辉. 2004

[10]ISSR分子标记技术的原理及其在茶树上的应用. 段云裳,成浩,房婉萍. 2008

[11]ISSR标记在茶树品种遗传多态性研究中的应用. 唐玉海,郭春芳,张木清,陈常颂,陈荣冰. 2007

[12]分子标记技术在茶树资源与育种中的研究进展. 赵洋,杨阳. 2009

[13]分子标记在茶树遗传育种上的应用. 姚明哲,陈亮. 2003

[14]茶树表达序列标签(ESTs)及相关分子标记开发研究进展. 王丽鸳,成浩,曾建明,周健,韦康. 2010

[15]广西三江茶树种质资源遗传多样性分析. 蒙容君,陈亮,许原,林纬,周歧伟,谢义林,赖定清,赖家业. 2023

[16]分子标记技术在茶树杂种优势预测中的应用展望. 刘本英,成浩. 2007

[17]茶树EST-SSRs分布特征及引物开发. 王丽鸳,姜燕华,段云裳,成浩,周健,曾建明. 2009

[18]一个与茶树高茶氨酸含量相连锁的RAPD标记的研究. 季鹏章,张俊,王平盛,王玲仙,夏江东,黄兴奇. 2007

[19]茶树种质资源ISSR分子标记初步研究. 谭和平,徐利远,余桂蓉,杜文平,王宇星,钟昌松. 2006

[20]2022年茶树遗传育种研究进展. 李娜娜,王璐,郝心愿,向云攀,王波,蔡琼梅,丁长庆,曾建明,杨亚军,王新超. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序