不同代次的猪细小病毒(PPV S-1株)NS1基因的克隆与序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 谢巧
作者: 谢巧;李春华;张婉华;王英;蒋凤英;张春玲
作者机构:
关键词: 猪细小病毒;不同代次;NS1基因;序列分析
期刊名称: 上海农业学报
ISSN: 1000-3924
年卷期: 2009 年 25 卷 04 期
页码: 63-66
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据GenBank中猪细小病毒PPV NADL-2株NS1基因序列设计了一对引物,以PPV S-1分离株不同传代代次的DNA为模板,进行PCR扩增,将扩增产物分别克隆到pGEM-T载体中进行测序。结果表明:扩增片段长约2.2 kb,包含完整的NS1基因,共编码662个氨基酸。应用DNAStar软件进行序列分析,结果显示:所有代次的NS1核苷酸同源性在99.4%以上,氨基酸同源性在98.5%以上;PPV S-1分离株在传代致弱的过程中,NS1基因出现了一些变异,有4处较为一致的突变,即1 052位C→T、1 636位G→A、1 717位A→G、1732位T→G,对应的氨基酸变化分别为Thr~(351)→Met~(351)、Val~(546)→Met~(546)、Asn~(573)→Asp~(573)、Ser~(578)→Ala~(578),这可能是PPV S-1在ST细胞上传代致弱的分子基础之一。
分类号: S852.65
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