基于SSR标记的西南地区野生带叶兜兰资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐言

作者： 徐言;陈之光;徐玉凤;葛红;杨树华;赵鑫;寇亚平;于晓南;贾瑞冬

作者机构：

关键词： 带叶兜兰;野生居群;SSR标记;遗传多样性;遗传结构

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2023 年 44 卷 011 期

页码： 2208-2218

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 带叶兜兰[Paphiopedilum hirsutissimum(Lindl.ex Hook.f.)Stein]具有较高的观赏价值,是中国珍稀濒危保护植物.为了研究中国西南地区野生带叶兜兰资源的遗传特性,促进野生带叶兜兰资源的保护和利用,本研究利用SSR分子标记技术对中国西南地区广西、云南、贵州 3 省(区)收集的 6 个居群 190 份带叶兜兰资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析.结果表明:从 115 对引物中共筛选出 10 对扩增效果好的引物,10 对SSR引物在 190 份带叶兜兰中共检测到 50 个等位基因,平均每个位点等位基因(Na)为 5 个,平均有效等位基因数(Ne)为 2.4835 个;平均Shannon信息指数(I)为 0.8592,平均观测杂合度(Ho)为 0.4518;平均期望杂合度(He)为 0.4387,平均Nei's基因多样性指数(h)为0.4370,平均多态信息含量(PIC)为0.3996.6个野生带叶兜兰居群的Na为2.8000~4.3000,Ne为1.9655~2.4060,Ho为 0.3891~0.4839,He为 0.3795~0.4683,Shannon 信息指数(I)为 0.6584~0.8369,Nei's 基因多样性指数(h)为0.3648~0.4382.广西雅长(GYC)和贵州万峰湖(QWF)居群具有较高的遗传多样性(h=0.4382,h=0.4276),广西木论(GML)居群具有最低的遗传多样性(h=0.3648).分子方差分析(AMOVA)结果表明,遗传变异主要发生在居群内个体间(94%),而居群内遗传分化很小(6%).基于遗传距离构建的 UPGMA 聚类分析结果显示,6 个居群遗传距离较小,居群间遗传距离和地理位置不完全相关.Structure 和主坐标分析结果表明,居群间存在均质化现象,无明显类群划分.综上,带叶兜兰资源遗传多样性较为丰富,研究结果可为中国西南地区野生带叶兜兰资源的保护和利用提供理论依据.

分类号： S682.31

  • 相关文献

[1]大麦SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析. 王晋,王世红,赖勇,孟亚雄,李葆春,马小乐,尚勋武,王化俊. 2014

[2]180份玉米自交系亲缘关系的分子评价. 乔治军,刘龙龙,南晓洁,赵秀娟,王海岗. 2011

[3]“十五”大豆创新种质和1963—1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析. 李英慧,刘燕,关荣霞,魏淑红,杨光宇,周新安,张孟臣,杨春燕,朱保葛,李卫东,刘学义,徐冉,孙君明,朱申龙,赵团结,刘章雄,常汝镇,邱丽娟. 2007

[4]基于SSR的西南地区野生菰资源遗传多样性及遗传结构分析. 黄雪雯,王惠梅,苏晓娜,王圣子海,熊琦哲,江绍琳,吴建利,江绍玫. 2017

[5]四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析. 王玲,左示敏,张亚芳,陈宗祥,潘学彪,黄世文. 2015

[6]利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构. 苏晓娜,王惠梅,黄雪雯,谢小燕,张孝天,牛恋,董琳,江绍琳,吴建利,江绍玫. 2018

[7]"十五"大豆创新种质和1963-1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析. 李英慧,刘燕,关荣霞,魏淑红,杨光宇,周新安,张孟臣,杨春燕,朱保葛,李卫东,刘学义,徐冉,孙君明,朱申龙,赵团结,刘章雄,常汝镇,邱丽娟. 2007

[8]基于SSR标记的山西高粱地方品种遗传多样性和遗传结构分析. 李萌,秦慧彬,王宇楠,闫建俊,穆志新. 2020

[9]云南粳稻遗传多样性及群体结构分析. 管俊娇,杨晓洪,张建华,王江民,张鹏,李彦刚. 2018

[10]秦巴山区野板栗居群遗传多样性AFLP分析. 艾呈祥,沈广宁,张凯,田寿乐,许林. 2011

[11]胡枝子属野生居群遗传多样性的等位酶分析. 袁庆华,张吉宇,张文淑. 2006

[12]胡枝子属植物野生居群遗传多样性RAPD分析. 张吉宇,袁庆华,王彦荣,张文淑. 2006

[13]玉米耐盐种质筛选及群体遗传结构分析. 郝德荣,程玉静,徐辰武,冒宇翔,彭长俊,薛林. 2013

[14]利用微卫星标记分析山西糜子的遗传多样性. 王舒婷,何杰丽,石甜甜,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2019

[15]云南不同稻区稻瘟病菌群体遗传结构的SSR分析. 刘树芳,张先闻,董丽英,刘沛,田维逵,周伍民,杨勤忠. 2023

[16]四川野生斑茅居群遗传结构的SRAP分析. 张瑜,鄢家俊,白史且,彭燕,梁绪振,张建波,张劲,胡超. 2015

[17]仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析. 潘传燕,臧云鹏,廖梅杰,王印庚,荣小军,张正,李彬,陈贵平. 2012

[18]利用微卫星PCR分析普安乌骨鸡的遗传结构. 唐继高,朱丽莉,李洪曙,王清颖,韩雁雁. 2015

[19]利用线粒体序列分析黑龙江和松花江流域乌苏里拟鲿种群遗传结构. 吴静,张研,霍堂斌,孙效文. 2013

[20]增殖放流对日本囊对虾群体遗传多样性的影响评估. 魏鸿擎,张凤英,蒋科技,姜亚洲,孟永永,宋炜,马春艳,程家骅,马凌波. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序