基于SSR标记的西南地区野生带叶兜兰资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐言

作者： 徐言;陈之光;徐玉凤;葛红;杨树华;赵鑫;寇亚平;于晓南;贾瑞冬

作者机构：

关键词： 带叶兜兰;野生居群;SSR标记;遗传多样性;遗传结构

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2023 年 44 卷 011 期

页码： 2208-2218

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 带叶兜兰[Paphiopedilum hirsutissimum(Lindl.ex Hook.f.)Stein]具有较高的观赏价值,是中国珍稀濒危保护植物.为了研究中国西南地区野生带叶兜兰资源的遗传特性,促进野生带叶兜兰资源的保护和利用,本研究利用SSR分子标记技术对中国西南地区广西、云南、贵州 3 省(区)收集的 6 个居群 190 份带叶兜兰资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析.结果表明:从 115 对引物中共筛选出 10 对扩增效果好的引物,10 对SSR引物在 190 份带叶兜兰中共检测到 50 个等位基因,平均每个位点等位基因(Na)为 5 个,平均有效等位基因数(Ne)为 2.4835 个;平均Shannon信息指数(I)为 0.8592,平均观测杂合度(Ho)为 0.4518;平均期望杂合度(He)为 0.4387,平均Nei's基因多样性指数(h)为0.4370,平均多态信息含量(PIC)为0.3996.6个野生带叶兜兰居群的Na为2.8000~4.3000,Ne为1.9655~2.4060,Ho为 0.3891~0.4839,He为 0.3795~0.4683,Shannon 信息指数(I)为 0.6584~0.8369,Nei's 基因多样性指数(h)为0.3648~0.4382.广西雅长(GYC)和贵州万峰湖(QWF)居群具有较高的遗传多样性(h=0.4382,h=0.4276),广西木论(GML)居群具有最低的遗传多样性(h=0.3648).分子方差分析(AMOVA)结果表明,遗传变异主要发生在居群内个体间(94%),而居群内遗传分化很小(6%).基于遗传距离构建的 UPGMA 聚类分析结果显示,6 个居群遗传距离较小,居群间遗传距离和地理位置不完全相关.Structure 和主坐标分析结果表明,居群间存在均质化现象,无明显类群划分.综上,带叶兜兰资源遗传多样性较为丰富,研究结果可为中国西南地区野生带叶兜兰资源的保护和利用提供理论依据.

分类号： S682.31

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