文献类型： 中文期刊
第一作者： 王富强
作者： 王富强;张建;温常龙;樊秀彩;张颖;孙磊;刘崇怀;姜建福
作者机构：
关键词： 葡萄;KASP标记;品种鉴定;指纹图谱;遗传多样性分析
期刊名称： 中国农业科学
ISSN：
年卷期： 2021 年 013 期
页码： 2830-2846
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】开发一组能够区分中国主栽葡萄品种的竞争性等位基因特异性PCR（KASP）分子标记,为中国葡萄品种保护、品种登记和市场维权等提供技术支撑。【方法】基于前人筛选的60个葡萄高多态性SNP位点,转化为KASP标记。分别使用23份代表性品种和76份主要栽培品种对转化成功的KASP标记进行初筛、复筛、验证,获得一组高质量的KASP标记,并用于构建76份葡萄品种的DNA指纹图谱。【结果】60个SNP位点有3个不具备基因组特异性,6个无法设计KASP-PCR引物,最终51个SNP成功转化为KASP标记,转化率达到89.47%。利用LGC-SNPline平台对23份代表性品种进行基因分型,51个KASP标记全部成功分型。基于次要等位基因频率（MAF）大于0.25、多态性信息含量（PIC）大于0.35、缺失率小于0.2、杂合率小于0.6等参数,初步筛选出27个优质KASP标记。使用构建指纹图谱的76份品种复筛出22个高质量KASP标记。22个KASP标记的缺失率均小于0.12,PIC均大于0.3,杂合率在0.4—0.6的标记占77.27%,MAF大于0.3的标记占95.45%。此外,利用这22个标记对同一品种不同树体提取的23份代表性品种的DNA扩增检测,前后两次检测分型结果稳定一致,表明这22个标记具有较好的重复性和稳定性。进一步将基于22个标记获得的76份葡萄品种分型结果转化为二元编码数据,得到76份葡萄品种的指纹图谱。经邻接聚类分析和群体结果分析,可将76份葡萄品种分为3类,并能正确区分二倍体和多倍体。仅用10个标记（VIT1518567587、VIT64258638、VIT83320936、VIT1222228357、VIT1119390306、VIT1617950801、VIT1811138668、VIT12739916、VIT1613454358、VIT1621202286）就能区分70份品种,其中有54份品种达到品种鉴定的标准（差异位点数≥2）。【结论】从60个葡萄SNP中成功转化51个KASP标记,并筛选出22个高质量KASP标记,构建了76份葡萄品种的SNP指纹图谱,首次验证了KASP技术在我国葡萄品种鉴定中的可行性。
分类号： S663.1
- 相关文献
[1]基于核心KASP标记的江苏粳稻品种DNA指纹图谱构建. 朱小品,徐婷婷,孟珊,杨雪,杨欣,朱银,狄佳春,郭春滨,王宁,颜伟. 2024
[2]基于高通量芯片的大麦高效KASP标记的开发和应用. 徐婷婷,孟珊,朱小品,邹淑琼,狄佳春,杨欣,朱银,郭春滨,颜伟. 2024
[3]SNP分子标记及其在木本植物遗传育种的应用. 周琳,段玉,文博,马媛春,朱旭君,王玉花,房婉萍. 2018
[4]用于工业大麻种质资源筛选和鉴定的KASP标记集开发. 周佳,张园,郭孟璧,吕品,杜光辉,许艳萍,杨明,张庆滢,字雪靖,陈璇. 2024
[5]湖北省水稻区试两系不育系指纹图谱构建及遗传相似性分析. 蔡海亚,谢红卫,周雷,焦春海,游艾青. 2016
[6]基于InDel标记的国内绿豆品种遗传多样性分析及指纹图谱构建. 李群三,陈景斌,顾和平,袁星星,陈新,崔瑾. 2019
[7]非洲水稻种质资源SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析. 黄瑞,周雷,何卫,李三和,陈志军,刘凯,闸雯俊,杨国才,焦春海,游艾青. 2015
[8]茄子全基因组SNP标记的开发. 肖熙鸥,聂珩,林文秋,吴彩玉. 2025
[9]甘蔗(Saccharum officinarum L.)品种遗传差异的AFLP分子标记分析. 谭裕模,李杨瑞,李容柏,高国庆. 2004
[10]用AFLP分子标记技术鉴别甘蔗(Saccharum of ficinarum L.)品种. 谭裕模,李杨瑞,李容柏,高国庆. 2003
[11]利用SSR构建甜菜品种的分子身份证. 栗媛,王茂芊,邳植,吴则东. 2019
[12]部分两用桃品种(系)指纹图谱的建立. 李雪莲,王尚德,刘佳棽,兰彦平,康向阳. 2010
[13]基于SSR分子标记的福建百香果品种(系)鉴定及指纹图谱构建. 魏秀清,李亮,熊亚庆,许玲,章希娟,陈志峰,宋奇洁,许家辉. 2022
[14]利用SSR分子标记建立杂交水稻指纹图谱. 宋书锋,刘全胜,付岳峰,符习勤,戴恒. 2008
[15]11个德国甜菜品种指纹图谱的构建. 吴则东,王华忠,马龙彪,王茂芊. 2013
[16]利用SSR标记鉴定柚和杂柑品种. 雷天刚,何永睿,吴鑫,刘小丰,许兰珍,彭爱红,陈善春. 2007
[17]湖南省审定的杂交稻品种DNA指纹图谱的构建与分析. 朱克永,詹庆才. 2014
[18]ISSR分子标记技术在桃品种鉴定中的应用. 李靖,陈栋,谢红江,涂美艳,江国良. 2011
[19]AFLP分子标记应用于白菜品种鉴定. 李丽,郑晓鹰. 2006
[20]用SRAP标记分析黄瓜品种遗传多样性及鉴定品种. 李丽,郑晓鹰,柳李旺. 2006
作者其他论文 更多>>
-
磁性二氧化硅复合材料制备及其对磺酰脲类除草剂的吸附研究
作者：张颖;叶宇航;司文帅
关键词：磁性二氧化硅复合材料;制备;表征;吸附;磺酰脲
-
不同秸秆还田量对土壤团聚体及有机碳含量的影响
作者：赵炳地;张久明;朱莹雪;匡恩俊;袁佳慧;迟凤琴;孙磊;李宁
关键词：秸秆还田量;水稳性团聚体;团聚体有机碳;有机碳贡献率
-
129份葡萄属(Vitis L.)种质资源枝条抗寒性鉴定评价
作者：吴文桐;马潇乐乐;王星;林美苓;徐志鹏;刘崇怀;郭印山;姜建福
关键词：葡萄属;抗寒性;评价;低温半致死温度;差热分析
-
母体高尿酸血症对妊娠的影响及其表观遗传机制的研究进展
作者：张燠诗;范冰峰;张颖;许保增
关键词：高尿酸血症;妊娠;代谢综合征;表观遗传
-
基于电子鼻的酿酒葡萄果实香气鉴定评价
作者：刘学伟;刘崇怀;樊秀彩;张颖;孙磊;黄丽亚;姜建福;牛生洋
关键词：电子鼻;酿酒葡萄;种质资源;香气
-
智慧农业在我国葡萄水肥一体化技术上的应用现状
作者：张聪颖;李世峰;任建成;闫爱玲;王慧玲;刘振华;王晓玥;孙磊
关键词：智慧农业;水肥一体化;葡萄;应用现状
-
外源性雄激素17ɑ-甲基睾酮诱导性逆转过程中施氏鲟肝脏转录组的分析研究
作者：何铮;李禹韬;王若愚;曹顶臣;孙志鹏;王思涵;张依宁;张颖
关键词：17α-甲基睾酮;性腺组织学;类固醇激素;转录组测序
