欧洲葡萄NF-YB3基因克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 崔小月

作者： 崔小月;尚泓泉;吕中伟;娄玉穗;张柯;樊红杰;吴文莹;张晓锋

作者机构：

关键词： 葡萄;NF-YB3;基因克隆;生物信息学分析;表达分析

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 111-118

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究VvNF-YB3基因在葡萄生长发育和响应非生物胁迫过程中的功能，以无核白为试材，克隆得到了VvNF-YB3基因编码区序列，全长为624 bp，编码207个氨基酸，蛋白质等电点6.31，不稳定指数27.66，总平均疏水指数-0.738，为一酸性、稳定的亲水蛋白。通过生物信息学分析发现，VvNF-YB3基因位于10号染色体，含有1个内含子，编码蛋白质存在1个CBFD＿NFYB＿HMF结构域，与河岸葡萄NFYB3相似性最高。VvNF-YB3的二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比较高，三级结构为单体的螺旋-卷曲-螺旋，启动子中包含响应激素和胁迫的多个顺式作用元件。VvNF-YB3基因在葡萄的叶片、卷须、花、幼果和茎中均表达，且在成熟的叶片中表达量最高。PEG模拟的干旱、低温和高温胁迫均可影响VvNF-YB3基因的表达，VvNF-YB3为一胁迫响应基因。VvNF-YB3的互作蛋白大多是核因子Y家族的亚基，ERF、bHLH、ARF等27个转录因子可能调控VvNF-YB3基因的表达。由此推测，VvNF-YB3基因可能通过受到上游转录因子的调控并与其他NF-Y蛋白互作响应各种环境胁迫。

分类号： S663.1

  • 相关文献

[1]葡萄SBP-box转录因子家族的生物信息学分析及其应答激素调控葡萄果实成熟的作用. 崔梦杰,王晨,冷翔鹏,吴伟民,汤崴,张文颖,朱旭东,贾海锋,沈文飚,房经贵. 2018

[2]葡萄UDP-糖基转移酶家族的全基因组表征、进化和表达分析. 王媛媛,刘云清,徐晶宇,刘云婷,胡禧熙,张超,姜泽宇,朱磊. 2025

[3]菊花抗白色锈病相关基因CmDREBa-2的克隆及表达分析. 熊超明,赵兴华,贾红梅,延昕,毛洪玉. 2018

[4]高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析. 方远鹏,蒋君梅,杜巧丽,陈美晴,裴会敏,屈志广,任明见,谢鑫. 2020

[5]高羊茅FaGST1基因克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈锡,赵德刚,陈莹,吴佳海,袁暘暘,王小利. 2020

[6]洋葱黄酮醇合成酶基因的克隆与表达分析. 王振宝,杨妍妍,刘冰江,霍雨猛,李艳伟,孙亚玲,吴雄. 2022

[7]木薯MeAFP2-like基因的序列特征及表达分析. 肖亮,尚小红,单忠英,曹升,曾文丹,严华兵. 2018

[8]白三叶TrDFR基因克隆及表达分析. 张婷婷,刘洋,许本波,田宏,熊军波,陆姣云,张鹤山. 2022

[9]陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析. 孟超敏,耿翡翡,卿桂霞,张富厚,李雪林,刘逢举. 2023

[10]海岛棉耐盐相关基因GbPLA1-32的克隆及生物信息学分析. 张红,张悦新,徐楠,芮存,范亚朋,王晶,韩明格,王琴琴,孙亮庆,陈修贵,陆许可,王俊娟,王德龙,王帅,郭丽雪,赵兰杰,陈超,陈全家,叶武威. 2024

[11]滇龙胆乙酰CoA转移酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王连春,王元忠. 2016

[12]芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析. 罗睿雄,赵志常,黄建峰,党志国,高爱平. 2016

[13]谷子NCED3基因克隆及生物信息学和表达模式分析. 王艳珂,黎飞飞,陈二影,杨延兵,管延安,高文伟,秦岭. 2022

[14]甘蔗蔗糖转运蛋白SoSUT5基因克隆、表达及功能鉴定. 苗小荣,王道波,杨丽涛,李杨瑞. 2018

[15]鸡Fnip1基因克隆、组织表达及生物信息学分析. 黄正洋,孔令琳,王钱保,李春苗,吴兆林,黄华云,赵振华. 2025

[16]小麦TaSRG1基因的克隆、生物信息学分析及表达特征. 徐灵,洪鼎立,邓云颢,徐如宏,李鲁华. 2024

[17]葡萄抗病相关基因VvIPK2的克隆、序列分析及表达. 王西成,吴伟民,赵密珍,钱亚明,王壮伟. 2014

[18]谷子SBP转录因子家族基因的表达分析. 杜晓芬,韩康妮,李禹欣,王智兰,连世超,王军. 2021

[19]小麦NPR1基因家族鉴定及其表达分析. 李雅倩,王林,宋婧含,牛红莉,朱光,高春保,方正武,刘易科. 2021

[20]基于转录组的‘三月李’及其红肉突变体ARF基因家族鉴定及分析. 方智振,姜翠翠,周丹蓉,潘少霖,叶新福. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序