欧洲葡萄NF-YB3基因克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 崔小月

作者： 崔小月;尚泓泉;吕中伟;娄玉穗;张柯;樊红杰;吴文莹;张晓锋

作者机构： 河南省农业科学院园艺研究所

关键词： 葡萄;NF-YB3;基因克隆;生物信息学分析;表达分析

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 111-118

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究VvNF-YB3基因在葡萄生长发育和响应非生物胁迫过程中的功能，以无核白为试材，克隆得到了VvNF-YB3基因编码区序列，全长为624 bp，编码207个氨基酸，蛋白质等电点6.31，不稳定指数27.66，总平均疏水指数-0.738，为一酸性、稳定的亲水蛋白。通过生物信息学分析发现，VvNF-YB3基因位于10号染色体，含有1个内含子，编码蛋白质存在1个CBFD＿NFYB＿HMF结构域，与河岸葡萄NFYB3相似性最高。VvNF-YB3的二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比较高，三级结构为单体的螺旋-卷曲-螺旋，启动子中包含响应激素和胁迫的多个顺式作用元件。VvNF-YB3基因在葡萄的叶片、卷须、花、幼果和茎中均表达，且在成熟的叶片中表达量最高。PEG模拟的干旱、低温和高温胁迫均可影响VvNF-YB3基因的表达，VvNF-YB3为一胁迫响应基因。VvNF-YB3的互作蛋白大多是核因子Y家族的亚基，ERF、bHLH、ARF等27个转录因子可能调控VvNF-YB3基因的表达。由此推测，VvNF-YB3基因可能通过受到上游转录因子的调控并与其他NF-Y蛋白互作响应各种环境胁迫。

分类号： S663.1

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