芥菜型油菜AHK家族成员的全基因组鉴定及调控粒质量性状的初步探索

文献类型： 中文期刊

第一作者： 游亮

作者： 游亮;陈浩;肖华贵;梁峰豪;张超;王璐璐;唐容;杨斌

作者机构：

关键词： 芥菜型油菜;AHK家族;粒质量性状;表达分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2024 年 39 卷 001 期

页码： 8-17

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究芥菜型油菜AHK家族蛋白的结构特征及其与粒质量性状相关的调控功能,采用生物信息学方法对芥菜型油菜AHK家族成员进行了全基因组鉴定、理化性质、系统发育树、蛋白结构、启动子顺式元件和不同组织表达谱等分析.结果表明,在芥菜型油菜基因组中共鉴定到19条BjAHK蛋白序列,系统发育树分析将BjAHK家族成员分为了4个分支,即 G1(BjAHK2~BjAHK4)、G2(BjAHK5)、G3(BjAHK1)和 G4(BjCKI1).功能结构域研究发现,BjAHK 家族成员具有6个核心基序(Motif1~Motif6),与HisKA、HATPase_c和REC保守结构域相对应,其中BjAHK1~BjAHK4和BjCKI1蛋白的N端含有较为保守的跨膜结构域,可能与其跨膜作用功能有关.不同组织表达谱研究发现,细胞分裂素受体蛋白基因(BjAHK2~BjAHK4)为泛表达基因,且在根组织中表达量最高.结合已有的芥菜型油菜粒质量性状转录组数据,成功挖掘出4个可能参与粒质量性状调控的基因BjA07.AHK3、BjB03.AHK3、BjA10.AHK5和BjB05.AHK5.其中,BjA07.AHK3和BjB03.AHK3可能正向调控种子发育,而BjA10.AHK5和BjB05.AHK5则负向调控.结合BjAHK基因家族分析和转录组测序结果,推测BjAHK3和BjAHK5基因在调控芥菜型油菜种子发育方面发挥重要功能.

分类号： Q78%S635.03

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