基于EST数据的柞蚕SSR标记开发

文献类型: 中文期刊

第一作者: 郑茜茜

作者: 郑茜茜;马红方;谌苗苗;钟亮;李群

作者机构:

关键词: 柞蚕;表达序列标签;简单重复序列

期刊名称: 蚕业科学

ISSN: 0257-4799

年卷期: 2016 年 01 期

页码: 76-82

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 柞蚕SSR标记的开发对研究柞蚕的遗传与进化、分子遗传图谱构建、功能基因定位和克隆等有重要意义。从1 500条柞蚕表达序列标签(EST)中鉴定了71个SSR位点,平均5.2 kb出现1个SSR位点,在1~6个碱基的重复基元中,以3个和4个核苷酸重复为主导类型。设计合成了29对EST-SSR引物,通过PCR扩增和电泳检测鉴定了7对具有多态性的引物,测序验证结果表明其中的4对为有应用价值的EST-SSR标记。建立的利用EST数据开发柞蚕SSR标记的方法,有助于进一步大量开发柞蚕SSR分子标记。

分类号: S885.1

  • 相关文献

[1]中国重要农业害虫韭菜迟眼蕈蚊多态性EST-SSR标记的开发(英文). 张存环,台术蕾,王磊,郭雅男,杨峰山,赵传志,万方浩,褚栋. 2016

[2]尖镰孢EST-SSR信息分析及分子标记建立. 李新凤,张作刚,王建明,高俊明,田宏先. 2014

[3]柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序. 夏润玺,李玉萍,王欢,李喜升,刘彦群,秦利,姜德富,鲁成. 2009

[4]玉米O2和Wx基因内及O16基因连锁SSR位点的等位变异研究. 杨留启,杨文鹏,牛素贞,王明春. 2009

[5]12份糯玉米自交系的SSR标记多态性和分子分类研究. 杨留启,杨文鹏,王明春,任洪. 2009

[6]绒毛状烟草基因组中SSR位点的信息分析. 王卫锋,晁江涛,龚达平,王鲁,李凤霞,陈雅琼,孙玉合. 2011

[7]稻瘟病菌株CH63和TH16杂交组合的遗传图谱构建及无毒基因定位. 王艳丽,Claudia KAYE,Amandine BORDAT,Henri ADREIT,Jo■lle MILLAZZO,郑小波,沈瑛,Didier THARREAU. 2005

[8]黑木耳59个菌株的遗传多样性分析. 潘春磊,王延锋,盛春鸽,王金贺,张鹏,于海洋. 2022

[9]基于遗传多样性构建金针菇的核心种质群体及分子身份证. 高利慧,鲍大鹏,徐珍,李燕,陆欢,TAN Yee Shin,尚晓冬,陈洪雨,王瑞娟,吴莹莹. 2021

[10]籼稻脂肪酶基因的遗传分析及定位. 龚继平,吴方喜,吴跃进,郑家团,黄庭旭,王乌齐,张建福,谢华安. 2008

[11]花椰菜转录组SSR位点分析及其分子标记开发. 林珲,李永平,薛珠政,陈敏氡,朱海生,温庆放. 2019

[12]利用SSR分析普通野生稻自然居群交配系统. 刘勇,段永红,王淑红,詹庆才,孙桂华,高立志. 2010

[13]简单重复序列(AAG)_5在百萨偃麦草染色体上的分布. 温辉芹,裴自友,任永康. 2011

[14]湖北巴东县野生茶树种质资源遗传多样性及种群结构亲缘关系分析. 崔清梅,梁金波,马会杰,胡双玲,陈清华,吴立赟,何梦迪,王留彬,谭立才,张强,王丽鸳. 2024

[15]黄颡鱼遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位. 葛学亮,尹洪滨,毕冰,孙中武. 2010

[16]基于全基因组序列的香菇商业菌种SSR遗传多样性分析及多位点指纹图谱构建的研究. 张丹,宋春艳,章炉军,巫萍,鲍大鹏,尚晓冬,谭琦. 2014

[17]巴西橡胶树TCTP基因结构分析及分子标记开发. 邓治,覃碧,冯福应,李德军. 2012

[18]马铃薯基因组编码区域SSR位点的分布、特征和所编码蛋白功能分析. 孙亭亭,王大伟,陈乐,王卫峰,龚达平,陈雅琼,孙玉合. 2015

[19]大豆疫霉ISSR-PCR反应体系的建立. 李莹,文景芝,刘春来. 2005

[20]84个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的SSR分析. 董丽娟,段继华,李赛君,张曙光. 2011

作者其他论文 更多>>