凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因的克隆及其与耐寒性状的相关性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭金霞

作者： 彭金霞;殷勤;崔亮;王志伟;李奎;陈晓汉

作者机构：

关键词： 凡纳滨对虾;TCP-1-Beta;SNP;PCR-RFLP;耐寒力指标CDH值

期刊名称： 水生生物学报

ISSN： 1000-3207

年卷期： 2011 年 35 卷 04 期

页码： 604-609

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理,研究克隆了凡纳滨对虾耐寒相关基因TCP-1-Beta并对其与耐寒性状的关系进行了研究。根据电子克隆所得序列设计引物,采用RT-PCR方法克隆得到长1691 bp的凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因序列,其中包括1608 bp的完整开放阅读框,编码535个氨基酸残基。然后,运用荧光定量PCR对TCP-1-Beta基因进行时空表达谱的分析:组织表达谱的结果显示,该基因在凡纳滨对虾肝胰腺组织中表达量最高;不同低温处理下的表达结果显示,在28℃和15℃处理下基因表达量无显著变化,13℃开始呈上调表达,11℃时表达量升高;13℃低温处理发现该基因在24h内表达量无显著变化,但36h后表达量显著升高。采用PCR-RFLP方法对216尾凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因进行了SNP多态性检测,并将其与耐寒性状进行了关联分析。在该基因编码区第420碱基上发现G/A突变,方差分析结果表明该位点的不同基因型与耐寒力指标CDH值相关(P<0.05),其中GG基因型的耐寒能力比AA基因型强。

分类号： S917.4

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