基于高能碳离子辐射的野生大豆突变群体百粒重GWAS分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘秀林

作者： 刘秀林;赵克臻;王雪扬;张丰屹;袁荣强;张春蕾;任洪雷;苗丽丽;王家军;张必弦

作者机构：

关键词： 大豆;百粒重;GWAS

期刊名称： 种子

ISSN： 1001-4705

年卷期： 2025 年 44 卷 007 期

页码： 1-10,48

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 籽粒百粒重是大豆产量构成三要素之一，百粒重大小决定大豆产量并影响其商品性，百粒重也是大豆遗传改良关键性状。为进一步挖掘籽粒大小相关基因，解析籽粒大小的调控机制。利用碳离子束(Carbon Ion Beam, CIB)辐射野生大豆(ZYD7068),构建了200份百粒重变异丰富的野生大豆突变群体。结果表明，群体籽粒百粒重在4.37～16.74 g之间，平均值为7.13 g,突变群体百粒重较野生大豆百粒重提高了4.98倍。对200个突变体采用全基因组测序，共获得184.1亿bp的测序数据，基因组覆盖率68.10%～70.96%。突变主要是单碱基突变(SNP),其中C到T突变占突变总数的40%。对候选SNP基因进行富集分析，突变基因主要富集在Go:0009626(植物超敏反应)、Go:0034050(共生体诱导宿主程序性细胞死亡)、Go:0012501(程序性细胞死亡)、Go:0043680(丝状器)以及Go:0045087(先天免疫反应)等途径。利用全基因组测序获得的SNPs标记，采用MLM模型，对突变群体籽粒百粒重进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association GWAS),共检测到71个关联SNPs(-lgP>11),分别位于大豆2、3、5、6、9、10、14、16、18号染色体上，其中5、10号染色体和14号染色体以及18号染色体分别检测到9、21、9、23个SNPs, 71个关联SNPs位点涉及33个基因。

分类号： S565.1

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