山西玉米丝黑穗病菌SSR遗传多样性与群体结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李新凤

作者： 李新凤;尉天春;王雪梅;姜晓东;杨俊伟;冯铸;王建明

作者机构：

关键词： 玉米丝黑穗病菌;SSR标记;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 921-933

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为明确山西省玉米丝黑穗病菌群体的遗传结构,为该病害的综合防控提供理论依据。采用SSR标记方法对山西省不同地区玉米丝黑穗病菌进行检测。结果显示,12个SSR分子标记在118株玉米丝黑穗病菌中共检测出30个等位基因,平均等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Shannon’s信息指数（I）、等位基因丰度（Ar）分别为2.5、1.768 6、0.614 4和2.175。平均观测杂合度（Ho,0.163 2）低于平均期望杂合度（He,0.396 5）,且近交系数（Fis,0.522 1）大于0。说明本试验检测到的等位基因数较少,但分布比较均匀,且由于群体内的杂合子缺失导致病原菌群体显著偏离了Hardy-Weinberg。6个地理群体的遗传分化处于中等水平（FST=0.050～0.055）,群体间基因交流频繁（Nm=1.563～121.109）。AMOVA分析结果进一步显示,遗传分化主要存在于群体内个体间（94.80%）,群体间的变异仅占5.2%。UPGMA聚类结果表明,供试群体可被划分为遗传分化明显的两个亚群,其中位于晋东南地区的晋城群体和长治群体聚为一个组群,位于晋中和晋北地区的其余4个群体聚为另一组群,与遗传结构分析结果一致,推断山西省玉米丝黑穗病菌群体可能来自于2个祖先亚群,且大多数菌株的遗传组分单一。

分类号： S435.131.42

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