志贺菌耐药性与非编码RNA的关系研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘翠翠

作者: 刘翠翠;魏小娟;周绪正;李冰;牛建荣;王婧;朱阵;张继瑜

作者机构:

关键词: 志贺菌;耐药性;非编码RNA;RNA-seq

期刊名称: 微生物学杂志

ISSN: 1005-7021

年卷期: 2014 年 34 卷 05 期

页码: 75-80

收录情况: CSCD

摘要: 采用RNA-seq技术对志贺菌耐药性与非编码RNA之间的关系进行研究。首先采用梯度剂量的环丙沙星诱导福氏志贺菌2a标准菌株产生耐药性而获得耐药菌株,然后提取标准菌株与耐药菌株的总RNA进行RNA-seq分析。结果显示,在福氏志贺菌的2个样品中共发现100个候选sRNA,并与sRNA的数据库比对得到注释信息,每个候选sRNA都对应着很多个靶标基因,而且靶标基因的表达也有明显差异。预测这些sRNA可能会通过调控耐药基因和一些与细胞增殖或凋亡相关的基因发挥作用,因此还需要挑选合适的候选sRNA并对其用荧光定量PCR实验进行验证。

分类号: R378.2

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