大豆DMP基因的生物信息学及基因多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周雅

作者： 周雅;张祥;赵权;孙建强;王晓波;邱丽娟

作者机构：

关键词： 大豆;GmDMP1;GmDMP2;单倍型分析;单倍体诱导系

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 1744-1754

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 双单倍体技术被广泛应用于加速植物育种，近年来，利用含有功能未知结构域DUF679膜蛋白（DMP）突变的玉米（Zea mays L.）株系作为单倍体诱导株系。本研究搜索与玉米DMP基因氨基酸序列同源率60%以上的大豆DMP基因，对其进行生物信息学分析；并结合2214份重测序数据库探究GmDMP基因在大豆中的分子机理及生物多样性。分析结果表明：GmDMP1（Glyma.18G097400）与GmDMP2（Glyma.18G098300），与玉米DMP基因的进化关系亲缘度极高，基因全长均为645 bp，氨基酸序列同源率高达95%以上，编码氨基酸数目与等电点完全一致，磷酸化分布仅有1个位点差异。GmDMP1与GmDMP2基因均有1个相同的结构域DUF679，定位于内质网的可能性较大，均为跨膜的不分泌亲水蛋白。GmDMP1与GmDMP2基因在2214份种质资源中分别发生了3个与1个非同义突变，各组成3种和2种单倍型。GmDMP1H3在驯化中受到了强烈的选择，GmDMP1H1与GmDMP1H2单倍型的突变位点在结构域DUF679上。将大豆的两个DMP基因突变后可能获得单倍体诱导系，从而缩短大豆育种年限。

分类号： S565.1

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