大豆DMP基因的生物信息学及基因多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 周雅
作者: 周雅;张祥;赵权;孙建强;王晓波;邱丽娟
作者机构: 安徽农业大学农学院;中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业农村部北京大豆生物学重点实验室
关键词: 大豆;GmDMP1;GmDMP2;单倍型分析;单倍体诱导系
期刊名称: 植物遗传资源学报
年卷期: 2023 年 006 期
页码: 1744-1754
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 双单倍体技术被广泛应用于加速植物育种,近年来,利用含有功能未知结构域DUF679膜蛋白(DMP)突变的玉米(Zea mays L.)株系作为单倍体诱导株系。本研究搜索与玉米DMP基因氨基酸序列同源率60%以上的大豆DMP基因,对其进行生物信息学分析;并结合2214份重测序数据库探究GmDMP基因在大豆中的分子机理及生物多样性。分析结果表明:GmDMP1(Glyma.18G097400)与GmDMP2(Glyma.18G098300),与玉米DMP基因的进化关系亲缘度极高,基因全长均为645 bp,氨基酸序列同源率高达95%以上,编码氨基酸数目与等电点完全一致,磷酸化分布仅有1个位点差异。GmDMP1与GmDMP2基因均有1个相同的结构域DUF679,定位于内质网的可能性较大,均为跨膜的不分泌亲水蛋白。GmDMP1与GmDMP2基因在2214份种质资源中分别发生了3个与1个非同义突变,各组成3种和2种单倍型。GmDMP1H3在驯化中受到了强烈的选择,GmDMP1H1与GmDMP1H2单倍型的突变位点在结构域DUF679上。将大豆的两个DMP基因突变后可能获得单倍体诱导系,从而缩短大豆育种年限。
分类号: S565.1
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