苏尼特羊Lnc_000588的组织表达及其在调控肌肉生长发育中互作分子的预测
文献类型: 中文期刊
第一作者: 宫文典
作者: 宫文典;王瑞雪;王荣;刘俊阳;穆卿;特日格勒;吴子贤;李蕴华;刘佳森;赵艳红
作者机构:
关键词: 长链非编码RNA(LncRNA);苏尼特羊;肌肉;靶基因
期刊名称: 农业生物技术学报
ISSN:
年卷期: 2022 年 012 期
页码: 2333-2343
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 苏尼特羊(Ovis aries)是我国优质的肉羊资源,也是我国北方地区主要羊肉来源之一。长链非编码RNA (long non-coding RNA, LncRNA)在绵羊肌肉发育中发挥重要作用。为预测Lnc_000588在苏尼特羊骨骼肌发育中的调控网络,本研究对其在不同部位的组织表达量进行了实时荧光定量PCR分析及靶向miRNA-mRNA的生物信息学互作预测。同时,在小鼠(Mus musculus)成肌纤维细胞(C2C12)中检测了Lnc_000588的表达量。Lnc_000588在各组织中均有表达,且在背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01);Lnc_000588在C2C12细胞中的表达量随着细胞分化时间的延长而增加,48 h以后极显著高于较早时的表达(P<0.01)。;Lnc_000588可能通过miRNA参与调控肌肉的生长发育,其中的3个miRNA的靶基因富集于Ras信号通路(oas04014:Ras signaling pathway)、Rap1信号通路(oas04015:Rap1 signaling pathway)和AMPK信号通路(oas04152:AMPK signaling pathway)等66条通路。综上,Lnc_000588在苏尼特羊肌肉组织的表达量极显著高于其他组织,推测其参与了C2C12细胞分化。本研究为探究LncRNA参与苏尼特羊肌肉组织的调控功能提供了科学依据。
分类号: S826.2
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