大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种mtDNA COⅠ序列的分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张大莉

作者： 张大莉;董仕;白俊杰;苗建发;胡莹;李胜杰;苗建新;张兴华;马冬梅

作者机构：

关键词： 大口黑鲈;COⅠ序列;遗传多样性;遗传距离;NJ系统树

期刊名称： 大连海洋大学学报

ISSN： 2095-1388

年卷期： 2014 年 03 期

页码： 212-216

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR技术对大口黑鲈Micropterus salmoides北方亚种(21尾)和佛罗里达亚种(19尾)的mtDNA COⅠ区段进行扩增,得到约1400 bp的扩增片段,经测序获得了碱基排列顺序清晰的1337 bp片段。北方亚种个体间没有变异,只检测到1种单倍型,与GenBank中大口黑鲈全序列(DQ536425)中的COⅠ区段相应部位比对,有5个碱基出现置换;佛罗里达亚种检测到5种单倍型,19个个体与本研究中的北方亚种比对,有41个碱基出现完全置换。将6种单倍型的序列提交GenBank后获得序列号为KF176376~KF176381,运用Mega 4.0软件计算两个亚种的碱基组成和碱基差异,北方亚种的单倍型多样性指数(H)、核苷酸多样性指数(Pi)和平均核苷酸差异性(k)均为0,佛罗里达亚种的H、Pi、k分别为0.784、0.003 42和4.573,两个亚种平均Kimura 2-parameter遗传距离为0.0351。研究表明,大口黑鲈佛罗里达亚种mtDNA COⅠ区段的遗传多样性高于北方亚种,该序列可作为鉴别两个亚种的DNA条形码。

分类号： S917.4

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