嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖及促生长特性相关基因挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 苏仪梅

作者： 苏仪梅;孙安妮;黄毓燕;杨婷婷;李杨瑞;邢永秀

作者机构： 广西大学农学院/广西高校作物栽培学与耕作学重点实验室;广西农业科学院甘蔗研究所/广西甘蔗遗传改良重点实验室/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室

关键词： 嗜麦芽窄食单胞菌;根系分泌物;趋化性;生物膜;全基因组

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2023 年 010 期

页码： 2831-2843

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】挖掘嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖和促生长特性相关基因，为探究其促生长作用机制提供理论参考。【方法】利用Nanopore测序技术平台对CA1菌株进行全基因组测序，将其基因组序列与GO、NR、KEGG、COG等数据库进行比对，获得基因功能注释信息，挖掘分析其功能特异性基因；使用基质培法收集甘蔗根系分泌物，并分析根系分泌物对菌株CA1的趋化性、生物膜形成和定殖相关基因表达的影响。【结果】嗜麦芽窄食单胞菌CA1基因组大小为4371327 bp，携带6个质粒，GC含量64.58%，其中4696个基因被注释预测，包括4525个蛋白编码基因、87个t RNA、13个rRNA和1个tmRNA。GO、COG、KEGG和NR数据库分别成功注释2795、2078、2494和2584个基因。该菌基因组含有细菌趋化性（cheA、cheV、cheY）、生物膜形成（flhA、flk、flgG）、细菌黏附（pgaA、mrkD）、嗜铁（fes、fepA、fecA）、合成氨（gltP、gltB、gltD）和磷酸盐代谢（phoR、phoB、pstA）等促进植物生长和定殖相关的基因。趋化性试验结果显示，与对照组相比，根系分泌物处理下的菌落数显著增加（P＜0.05，下同），且cheA、cheV和cheY基因的相对表达量显著升高，CA1生物膜形成显著增加。【结论】甘蔗根系分泌物有助于菌株CA1的趋化性及生物膜形成，提高与趋化性相关基因的表达量。菌株CA1基因组含有多个与促生长和定殖特性相关的基因，是其促生长特性的分子基础，细菌的趋化性和生物膜的形成是其定殖的关键步骤，根系分泌物有利于菌株的定殖。

分类号： S566.1

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