禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孔令严

作者： 孔令严;汪最;邵华斌;张腾飞;卢琴;罗青平

作者机构：

关键词： 禽源多杀性巴氏杆菌;转录组测序;GO功能分析;KEGG功能分析;ARDB注释

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 30-36

收录情况： 北大核心

摘要： 为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(avian Pasteurella multocida,Pm)四环素(Tetracycline,Tet)敏感株与耐药株(MIC=32μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Tet敏感株与耐药株进行双向测序,通过GO、KEGG和ARDB数据库对表达差异基因进行注释和富集性分析。结果显示,共筛选出442个差异表达基因,其中包括103个上调基因和339个下调基因。通过GO功能富集分析显示差异表达基因多数富集于核糖体结构成分、rRNA结合、跨膜运输和离子转运等生物过程;对差异表达基因进行信号通路富集性分析,大多数差异表达基因分布在ABC转运蛋白与核糖体代谢途径中;对差异表达基因进行耐药基因注释(ARDB),发现其中的耐药基因主要为核糖体保护蛋白和外排系统两类。本研究表明禽源Pm对四环素耐药的耐药机制可能与细胞膜上ABC转运蛋白的过量表达以及核糖体保护蛋白有关。

分类号： S852.612

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