水分胁迫下燕麦萌发期转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 安江红
作者: 安江红;王力伟;斯钦巴特尔;赵梦然;刘红葵;赵沛义;何江峰
作者机构:
关键词: 燕麦;水分胁迫;转录组;基因挖掘
期刊名称: 西北农业学报
ISSN: 1004-1389
年卷期: 2025 年 34 卷 006 期
页码: 991-999
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解燕麦在萌发期应对水分胁迫的调控机理,以前期筛选的强抗旱性燕麦品种为试验材料,利用转录组测序技术研究水分胁迫对燕麦萌发期基因表达的影响.通过Illumina高通量测序平台对PEG-6000溶液模拟干旱条件下的燕麦萌发期种子进行转录组测序,以等体积蒸馏水处理为对照,结果6个样品共获得78.12 Gb的Clean data,各样品的Q30均大于92.8%.共鉴定到12 405个差异表达基因,其中,上调表达基因有5 110个,下调表达基因有7 295个;上调表达基因显著富集在丙烷、哌啶和吡啶生物碱的生物合成及类黄酮生物合成途径上,而下调表达基因显著富集在苯丙烷的生物合成和光合作用途径上;筛选出6个功能基因(分别是查尔酮合成酶、β葡萄糖苷酶、细胞色素P450、胚胎发育晚期富含蛋白、水通道蛋白和海藻糖-6-磷酸磷酸酶编码基因)与4个调节基因(WRKY、MYB、bZIP和NAC),作为进一步验证的候选基因.
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