海南杂草稻的落粒基因SH4和qSH1落粒SNP位点的序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 夏启玉

作者： 夏启玉;孔华;邹玲敏;吴清娟;姜晓琦;贺萍萍;曹扬;张雨良;赵辉

作者机构：

关键词： 杂草稻;SH4;qSH1;落粒SNP位点;序列分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2025 年 46 卷 007 期

页码： 1584-1593

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 种子的落粒性是导致杂草稻在水稻田不断自我繁衍和扩散的主要原因。SH4和qSH1基因被认为是控制水稻种子落粒的主效基因，本研究旨在测定海南杂草稻的SH4和qSH1的落粒SNP位点的基因型。本研究以临高县和崖州区水稻田中的杂草稻为研究材料，采集13块水稻田中的杂草稻及其对应栽培稻种子，从中选择144株表型有差异的杂草稻种子及13株对应栽培稻种子进行萌发种植，测定它们的种子落粒率，并对SH4和qSH1的落粒SNP位点进行PCR扩增及序列分析。结果表明：SH4基因的落粒SNP位点为野生落粒型G的杂草稻有77株，突变难落粒型T的杂草稻有48株，杂合型G/T的有19株；所有栽培稻的SH4的落粒SNP位点均为T。落粒率测定发现，SH4基因的落粒SNP位点为G和G/T的96株杂草稻都具有极高的落粒率，而SH4基因的落粒SNP位点为T的48株杂草稻中，40株为中度落粒率，8株为低落粒率。所有杂草稻和栽培稻样品的qSH1落粒SNP位点均为野生落粒型G。以上结果表明，海南杂草稻和栽培稻之间的落粒率差异与qSH1基因的落粒SNP位点无关，而与SH4基因的落粒SNP位点显著相关；SH4基因的落粒SNP位点均为T型的杂草稻和栽培稻间的落粒率差异可能由其他未知的基因或位点的差异导致。本研究结果可为海南杂草稻种子落粒的分子机制提供分子依据。

分类号： S451

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