猪流行性腹泻病毒感染猪小肠上皮细胞miRNA表达谱分析及验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张宸语

作者： 张宸语;陈佳宁;温建新;刘光亮

作者机构：

关键词： IPEC-J2;PEDV;miRNA;病毒复制

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2018 年 12 期

页码： 1095-1099

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)感染猪小肠上皮细胞(Porcine intestine epithelial cells J2,IPEC-J2)后对IPEC-J2的miRNA表达谱的影响,本实验将PEDV感染IPEC-J2,收获细胞并提取其总RNA,进行Hiseq高通量测序,构建感染组与未感染组的miRNA表达谱并进行聚类分析、GO(Gene ontology,GO)分析、KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)代谢通路分析和差异分析,并通过过表达novel-miR-877 mimic和ssc-mi R-219a mimic观察PEDV对IPEC-J2复制的影响。结果显示显著差异表达的已知miRNA有45个,未知mi RNA有249个,从其中随机挑选了差异表达较显著的16个mi RNA并采用q PCR进行验证,结果显示与测序结果一致;对这些差异miRNA进行GO分析,结果显示其广泛参与生物过程、细胞成分和分子功能的调节;通过KEGG代谢通路分析显示miRNA也参与Jak-STAT、Toll样受体等信号通路的调节;通过对novel-miR-877和ssc-miR-219a的过表达,显示PEDV复制均受到显著抑制。本研究为探究miRNA在PEDV复制中的作用奠定了基础。

分类号： S852.651

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