基于CO Ⅰ基因分析长江中下游陈氏新银鱼群体遗传多样性
文献类型: 中文期刊
第一作者: 袁佳
作者: 袁佳;方弟安;刘宝兴;李天佑;赵华丽;尤洋
作者机构:
关键词: 陈氏新银鱼;遗传多样性;细胞色素c氧化酶Ⅰ(CO Ⅰ)基因
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2025 年 44 卷 008 期
页码: 846-855
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 长江中下游地区生境多样,是陈氏新银鱼(Neosalanx tangkahkeii)的核心分布区域.为深入了解不同生境下陈氏新银鱼的遗传多样性和遗传分化情况,本研究利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ(cytochrome c oxidase Ⅰ,CO Ⅰ)基因序列作为遗传标记,对来自长江中下游泰州(Taizhou,TZ)、南京(Nanjing,NJ)、安庆(Anqing,AQ)、湖口(Hukou,HK)4个江段,以及鄱阳湖(Poyang Lake,PY)和洞庭湖(Dongting Lake,DT)2个通江湖泊的6个陈氏新银鱼群体进行了遗传多样性研究.研究结果表明,6个群体共检测出12个单倍型,单倍型多样性范围和核苷酸多样性范围分别为0.074~0.725,0.000 28~0.00202.6个群体的遗传多样性水平表现为PY群体最高,DT群体次之,然后依次是NJ、AQ、TZ和HK群体,群体间的遗传距离范围为0.000 46~0.001 96,NJ和PY群体之间的遗传距离最大,AQ群体和HK群体之间的遗传距离最小,不符合地理分布格局.群体间遗传分化系数Fst及遗传距离分析结果表明,PY和DT群体与其他群体的遗传距离相对较远.分子系统树和单倍型网络进化分析显示,PY和DT群体聚为一个分支.AMOVA分析发现,遗传变异主要来自群体内,中性检验、错配分布图及BSP(Bayesian skyline plot)结果表明陈氏新银鱼群体可能出现过群体扩张.
分类号: S917.4
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