猪睾丸表达序列37(TEX37)克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 霍海龙

作者： 霍海龙;张霞;范俐;赵筱;王世雄;王荣琼;刘丽仙;霍金龙

作者机构：

关键词： 睾丸表达序列37 (TEX37);版纳微型猪近交系;精子生成;荧光定量PCR;生物信息学

期刊名称： 云南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2020 年 005 期

页码： 775-780

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]以版纳微型猪近交系(Banna mini-pig inbred line, BMI)为材料,初步探索猪睾丸表达序列37(TEX37)基因的特性和功能,为该基因在猪精子生成过程的作用研究奠定基础.[方法]利用Oligo7软件设计特异引物扩增BMI TEX37基因整个编码区,应用实时荧光定量PCR技术检测BMI 15个组织的TEX37 mRNA表达谱,并初步预测TEX37蛋白质的功能,最后构建TEX37的多物种氨基酸系统进化树.[结果]扩增得到BMI TEX37编码区序列长561 bp,编码186个氨基酸,基因登录号KU705619,氨基酸登录号AOC89037.多组织相对荧光定量表达分析表明:TEX37基因在睾丸中呈相对最高表达,在其他组织中呈相对较低表达.生物信息学分析表明:TEX37蛋白质含有TSC21结构域,二级结构以无规则卷曲为主,N末端疏水,C末端亲水,有2类磷酸化位点,无跨膜螺旋结构和信号肽.系统聚类表明:BMI与其他物种相似度在67%以上,进化较保守.[结论]该研究可为TEX37基因在猪精子生成方面的作用机理研究提供参考.

分类号： S828

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