80份绿豆象抗感蚕豆种质资源SSR遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙虎

作者： 孙虎;刘昌燕;李莉;刘良军;韩雪松;万正煌;沙爱华;陈宏伟

作者机构：

关键词： 绿豆象;转录组测序;SSR;蚕豆;遗传多样性

期刊名称： 西南农业学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 683-691

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过转录组测序开发的SSR分子标记分析蚕豆种质资源遗传多样性，挖掘与蚕豆抗豆象性状相关的分子标记，为蚕豆抗豆象种质资源的保护利用及新品种选育提供参考依据。【方法】采用PacBio三代全长测序技术结合RNA-seq方法，对2个蚕豆品种Y134和Y078进行转录组测序，在此基础上，使用软件MISA对转录组所有Unigene序列进行搜索，寻找包含SSR核心基序的Unigene序列，并利用Primer 3.0批量设计引物。随机挑选100对SSR引物对80份蚕豆种质资源进行遗传多样性分析。【结果】100对SSR引物中有50对扩增出产物，有效扩增率为50%;其中32对引物表现出多态性。占有效产物的64%,占总引物的32%。在32对多态性引物中，每对引物扩增等位基因2～21个，平均值为6.875个；多态信息量（PIC）值为0.25～0.82,平均值为0.58;Shannon信息指数变化范围为0.34～2.31,平均值为1.21。基于UPGMA聚类分析将80份蚕豆材料在相似系数0.70处分为两大类：第1类包含65份种质，其中高抗（HR）品种62份，高感（HS）品种2份，感（S）品种1份；第2类包含15份种质，其中高感（HS）品种7份，感（S）2份，高抗（HR）品种5份，中抗（MR）1份。【结论】利用开发的SSR标记分析了80份蚕豆种质资源的遗传多样性，为蚕豆抗豆象种质资源鉴定与分子标记辅助选择育种等方面的研究奠定了理论基础。

分类号： S436.43

  • 相关文献

[1]国内外蚕豆核心种质SSR遗传多样性对比及微核心种质构建. 姜俊烨,杨涛,王芳,方俐,仲伟文,关建平,宗绪晓. 2014

[2]蚕豆抗绿豆象种质资源的鉴定. 张红岩,杨涛,关建平,杨生华,方俐,杜萌莹,宗绪晓. 2016

[3]不同地理来源蚕豆种质的绿豆象抗性特征分析. 杨新,杨峰,吕梅媛,于海天,胡朝芹,王玉宝,郑爱清,代正明,唐永生,代快,王丽萍,何玉华. 2022

[4]基于盐胁迫转录组信息的蚕豆F-box基因家族分析. 郝树琳,陈宏伟,廖芳丽,李莉,刘昌燕,刘良军,万正煌,沙爱华. 2020

[5]基于RNA-Seq技术的换锦花转录组分析. 李青竹,张永春,杨柳燕,孙翊,李心. 2017

[6]基于RNA-Seq技术的“紫娟”茶树转录组分析. 陈林波,夏丽飞,周萌,宋维希,李晓霞,焉文光,梁名志. 2015

[7]不同蚕豆品种农艺及品质性状的遗传多样性分析. 康智明,郑开斌,徐晓俞,李爱萍. 2015

[8]豌豆EST-SSR标记在蚕豆中的通用性与应用. 龚亚明,徐盛春,毛伟华,李泽昀. 2011

[9]蚕豆种质资源形态标记遗传多样性分析. 张小田,刘玉皎. 2009

[10]中国蚕豆种质资源ISSR标记遗传多样性分析. 王海飞,关建平,马钰,孙雪莲,宗绪晓. 2011

[11]上海蚕豆地方资源鉴定评价与遗传多样性分析. 朱吉风,周熙荣,王伟荣,孙滨,雷蕾,曹黎明. 2024

[12]蚕豆种质资源主要性状遗传多样性分析. 王晓娟,祁旭升,王兴荣. 2009

[13]蚕豆种质资源、抗病育种和QTL定位及抗逆性研究进展. 王海飞,宗绪晓. 2011

[14]南方90份秋播区蚕豆粒型性状的SSR关联分析. 刘金洋,周琰琰,林云,刘萌萌,薛晨晨,陈景斌,闫强,吴然然,陈新,袁星星. 2023

[15]利用SSR标记分析蚕豆品种(品系)与优异种质的遗传多样性. 张红岩,郭兴莲,杨涛,刘荣,黄宇宁,季一山,王栋,宗绪晓. 2018

[16]灰葡萄孢蚕豆分离物的遗传多样性. 黄燕,朱振东,段灿星,武小菲,东方阳. 2014

[17]利用130K液相芯片分析中国蚕豆种质资源遗传多样性. 张红岩,敏玉霞,滕长才,彭小星,陈志凯,周仙莉,娄树宝,刘玉皎. 2024

[18]35份皮燕麦种质遗传多样性的SSR和SRAP分析. 白晓雷,刘艳春,生国利,杨学文,王欣欣,唐超,路耿新. 2015

[19]基于SSR标记的梨资源遗传多样性分析. 张妤艳,吴俊,张绍铃. 2008

[20]大叶藻EST-SSR标记开发及其在大叶藻群体遗传多样性研究中的应用. 刘福利,刘坤,王飞久,孙修涛,汪文俊,梁洲瑞,马兴宇. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序