80份绿豆象抗感蚕豆种质资源SSR遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙虎

作者： 孙虎;刘昌燕;李莉;刘良军;韩雪松;万正煌;沙爱华;陈宏伟

作者机构：

关键词： 绿豆象;转录组测序;SSR;蚕豆;遗传多样性

期刊名称： 西南农业学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 683-691

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过转录组测序开发的SSR分子标记分析蚕豆种质资源遗传多样性，挖掘与蚕豆抗豆象性状相关的分子标记，为蚕豆抗豆象种质资源的保护利用及新品种选育提供参考依据。【方法】采用PacBio三代全长测序技术结合RNA-seq方法，对2个蚕豆品种Y134和Y078进行转录组测序，在此基础上，使用软件MISA对转录组所有Unigene序列进行搜索，寻找包含SSR核心基序的Unigene序列，并利用Primer 3.0批量设计引物。随机挑选100对SSR引物对80份蚕豆种质资源进行遗传多样性分析。【结果】100对SSR引物中有50对扩增出产物，有效扩增率为50%;其中32对引物表现出多态性。占有效产物的64%,占总引物的32%。在32对多态性引物中，每对引物扩增等位基因2～21个，平均值为6.875个；多态信息量（PIC）值为0.25～0.82,平均值为0.58;Shannon信息指数变化范围为0.34～2.31,平均值为1.21。基于UPGMA聚类分析将80份蚕豆材料在相似系数0.70处分为两大类：第1类包含65份种质，其中高抗（HR）品种62份，高感（HS）品种2份，感（S）品种1份；第2类包含15份种质，其中高感（HS）品种7份，感（S）2份，高抗（HR）品种5份，中抗（MR）1份。【结论】利用开发的SSR标记分析了80份蚕豆种质资源的遗传多样性，为蚕豆抗豆象种质资源鉴定与分子标记辅助选择育种等方面的研究奠定了理论基础。

分类号： S436.43

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