不同光周期条件下谷子株高的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 贾小平

作者： 贾小平;张博;全建章;李剑峰;王永芳;袁玺垒

作者机构：

关键词： 谷子;光周期;重测序;株高;全基因组关联分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 16-23

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示控制株高的遗传机理,为开展理想株型标记辅助选择育种奠定基础,在海南、洛阳、吉林3个不同种植区光周期条件下调查了98份谷子材料的株高,并对98份谷子材料进行基因组重测序,开展单核苷酸多态性(SNP)位点标记与株高的全基因组关联分析。结果表明:不同光周期条件下谷子株高的变异在58. 5～169. 3 cm,广义遗传力为0. 501,且随着日照时间的延长,谷子株高呈递增的趋势。基因组重测序获得了4 482 208个高质量的SNP位点,主成分分析将98份谷子材料分为3个亚群,连锁不平衡(LD)分析发现谷子基因组LD衰减距离为47. 5 kb。全基因组关联分析获得10 703个与株高关联的SNP位点(P <0. 000 1),这些位点多在海南种植区短日照条件下检测到,且集中于1号染色体上,只有1号染色体上3个关联SNP位点(SNP13861443、SNP14872616、SNP18601830)能在海南、洛阳2个种植区光周期条件下稳定检测到,说明谷子1号染色体存在海南、洛阳种植区短日照和中日照条件下控制株高的数量性状位点(QTL)。在关联SNP位点候选区域发现3个候选基因,推定为成蛋白的基因(LOC101783280)在外显子区检测到一个SNP位点(SNP14876527),推测该基因可能为控制谷子株高的主要候选基因。

分类号： S515

  • 相关文献

[1]烤烟烟碱含量的全基因组关联分析. 孙鑫,文柳璎,尹鹏嘉,罗成刚,樊文强,任民. 2017

[2]甘蓝型油菜RIL群体株高性状的全基因组关联分析. 黄静,程明星,唐敏强,张凤启,张园园,童超波,刘越英,程晓晖,董彩华. 2016

[3]玉米株高和穗位高的全基因组关联分析. 钱甫,张占琴,陈树宾,桑志勤,李卫华. 2024

[4]温热带玉米株高的全基因组关联分析. 郭子锋,徐孝洁,刘小刚,王山荭. 2020

[5]甘蓝型油菜株高性状的全基因组关联分析. 唐敏强,程晓晖,童超波,刘越英,赵传纪,董彩华,于景印,马小艮,黄军艳,刘胜毅. 2015

[6]CIMMYT新引进合成小麦株高性状全基因组关联分析. 张红杰,邓中印,陶姝,孙国梁,贾美玲,王振玉,廖如意,郑兴卫,李爱丽,毛龙,郑军,耿帅锋. 2021

[7]光周期对糜子生长发育及叶片内源激素的调控效应. 王君杰,田翔,秦慧彬,王海岗,曹晓宁,陈凌,刘思辰,乔治军. 2021

[8]海南短日照条件下谷子穗部性状的全基因组关联分析. 贾小平,张博,董志平,全建章,王永芳,张小梅,袁玺垒,李剑峰,戴凌峰. 2018

[9]谷子抽穗期基因SiGI的表达与单倍型变异分析. 姚琦,智慧,孟强,袁迪,张彬,刁现民,贾冠清. 2024

[10]洛阳、吉林生态区谷子抗倒伏性的全基因组关联分析. 贾小平,张博,全建章,王永芳,董志平,袁玺垒,李剑峰. 2018

[11]不同光周期环境对谷子农艺性状的影响. 贾小平,全建章,王永芳,董志平,袁玺垒,张博,李剑峰. 2019

[12]谷子SiPRR73基因的光温调控模式及非生物胁迫响应特性. 闫留延,李剑峰,张世文,张博,王永芳,张小梅,祖超凡,王振山,桑璐曼,何占祥,贾小平,董志平. 2022

[13]高产谷子品种高产机制. 琦明玉,张立媛,李红光,李志光,赵敏. 2019

[14]谷子中矮秆资源创制、遗传解析和育种利用. 刁现民,王立伟,智慧,张俊,李顺国,程汝宏. 2024

[15]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[16]利用混池重测序鉴定萨福克绵羊超数排卵关键调控基因. 滑留帅,辛晓玲,王璟,罗生金,曾滔,巴提玛,施巧婷,徐照学,王二耀. 2019

[17]利用重测序染色体片段代换系群体定位水稻籽粒长宽比QTL. 卫纯洁,陶亚军,范方军,李文奇,王芳权,许扬,陈智慧,仲维功,杨杰,王军. 2020

[18]基于重测序番茄InDel标记的开发. 张国儒,唐亚萍,杨涛,帕提古丽,王柏柯,李宁,王娟,李晓琴,余庆辉,杨生保. 2019

[19]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 2019

[20]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序