牦牛HYOU1基因克隆及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 季文博

作者： 季文博;王会;柴志欣;王吉坤;信金伟;钟金城

作者机构：

关键词： 牦牛;黄牛;HYOU1基因;生物信息学分析;组织表达谱

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2019 年 03 期

页码： 123-131

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究HYOU1基因在牦牛中的组织表达谱,通过对西藏牦牛HYOU1基因的CDS区进行克隆测序,分析该基因的结构和功能,采用RT-PCR技术检测黄牛和牦牛肺脏、心脏、肝脏、乳腺、大脑及肌肉中HYOU1基因的相对表达量。结果表明:(1)HYOU1基因CDS区长度为3 006 bp,其中A、G、C和T含量分别为25.0%、31.1%、26.7%和17.1%,存在一定碱基偏好性;发现1个(ACG→ACA)SNP位点,为同义突变。(2)生物信息学分析表明该蛋白呈中性,为较不稳定、亲水性分泌信号蛋白;存在一个跨膜螺旋(TMhelix)区位于13-35氨基酸位置;二、三级蛋白结构分析发现其主要的空间构象为:无规则卷曲及α-螺旋。(3)聚类分析显示,西藏牦牛与野牦牛的遗传距离最近,与瘤牛及普通牛的遗传距离次之,与水牛最远。(4)RT-PCR结果显示HYOU1基因在黄牛和牦牛肝脏、乳腺、肺脏、大脑、心脏、肌肉6个组织中均有表达,且相对表达量依次递减;在相同组织中,黄牛组织的表达量均显著高于牦牛组织中的表达量(P<0.05),其中黄牛肝脏组织的表达量为牦牛表达量的4.4倍。

分类号： S823.85`Q78

  • 相关文献

[1]类乌齐牦牛EGLN1基因克隆、生物信息学分析及差异表达. 管春燕,王吉坤,柴志欣,王会,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[2]牦牛Nramp1基因mRNA组织表达谱及其相关miRNAs初步研究. 温东旭,张雷,索朗斯珠,牛家强,王玉恒,贡嘎,旦巴次仁,席广银,郭敏,徐业芬. 2019

[3]云上黑山羊WNT11组织表达及其功能分析. 周祖阳,洪琼花,江炎庭,欧阳依娜,储明星,刘玉芳. 2023

[4]黄翅绢丝野螟气味受体基因GcaeOR10的鉴定及组织表达分析. 张绍华,孟倩倩,朱恩杭,查学宗,颜日辉,刘爱勤,吴刚,王政. 2023

[5]花生预苯胺酸脱氢酶基因AhADH的克隆及分子特性分析. 周双彪,张冲,陈华,蔡铁城. 2014

[6]FASN基因与牦牛肌内脂肪酸组成的相关性研究. 秦文,吴晓云,李天科,阎萍. 2014

[7]西北和西南五省（区）部分地区黄牛 牦牛牛病毒性腹泻/粘膜病血清学监测. 高双娣,邱昌庆,周继章,张永光,程淑敏,王永录,杨学礼,贾文孝,武占银,张小英. 1999

[8]牦牛和黄牛三个微卫星基因座种间特异性等位基因分析. 冯冬梅,赵会静,罗玉柱,韩建林. 2010

[9]低精料舍饲育肥条件下牦牛与黄牛生长性能、养分消化、瘤胃发酵和血液生理指标的对比研究. 甘水燕,刘红山,裴成芳,吴刀知才让,周建伟,李发弟. 2023

[10]牦牛Agouti基因的克隆及编码区多态性研究. 张建一,梁春年,吴晓云,张良斌,郭宪,裴杰,阎萍. 2014

[11]牦牛MDHI基因的克隆及组织表达分析. 陈露露,王会,柴志欣,钟金城,王吉坤,陈智华,姬秋梅,信金伟. 2019

[12]类乌齐牦牛UCP3基因克隆与序列分析. 季文博,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,钟金城. 2019

[13]牦牛RETN基因克隆及组织表达分析. 侯孟典,王会,柴志欣,王吉坤,信金伟,姬秋梅,钟金城. 2019

[14]牦牛VEGF-A基因的克隆及生物信息学分析. 吴晓云,阎萍,梁春年,郭宪,包鹏甲,裴杰,褚敏,丁学智,刘文博,焦斐,刘建. 2012

[15]牦牛和犏牛Dmrt7基因序列分析及其在睾丸组织中的表达水平. 金帅,郭宪,包鹏甲,梁春年,吴晓云,刘建,阎萍. 2013

[16]牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析. 秦文,阎萍,裴杰,吴晓云,李天科. 2013

[17]牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析. 金帅,齐社宁,阎萍,梁春年,郭宪,包鹏甲,裴杰,褚敏,丁学智,刘文博,吴晓云,刘建. 2012

[18]牦牛MITF-M基因序列分析及其在皮肤组织中表达水平. 张建一,梁春年,裴杰,郭宪,沈友明,阎萍. 2015

[19]牦牛ATP6和ATP8基因生物信息学分析. 吴晓云,阎萍,梁春年,郭宪. 2011

[20]牦牛CAPN3基因的克隆及组织表达特异性. 王英杰,阎萍,潘和平,吴晓云,李明霞. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序