木薯苹果酸脱氢酶结构与功能预测及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘畅

作者： 刘畅;薛晶晶;秦于玲;陈松笔

作者机构：

关键词： 木薯;MDH;结构与功能;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 4835-4841

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 木薯(Manihot esculenta Crantz)是世界重要的粮食作物,块根中富含淀粉,而苹果酸脱氢酶(MDH)在淀粉和糖代谢中具有重要作用。本研究采用生物信息学方法,对木薯MDH的其氨基酸序列、导肽、跨膜结构域、亲/疏水性、二级和三维结构及功能域进行分析及预测。结果表明,MDH在8种植物中的氨基酸组成成分基本一致,二级结构最大元件均为α-螺旋;MDH在大麦中为叶绿体基质蛋白,在小麦中为细胞质基质蛋白,木薯及其他作物中为线粒体基质蛋白;MDH在木薯中有2个功能域。以野生木薯近缘种W14(M.esculenta ssp.flabellifolia)块根为对照,利用q RT-PCR从转录水平对野生橡胶木薯(M.glaziovii)和栽培种SC205和SC8块根的MDH基因表达进行分析,发现MDH基因在橡胶木薯、SC205和SC8中均下调表达,这些结果对进一步验证木薯MDH的生物学功能提供重要依据。

分类号： S533

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