基于高通量测序的山羊卵巢基质、卵泡转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陆婷婷

作者： 陆婷婷;邹娴;杨镇玮;雷放;陈奕业;柳广斌;孙宝丽;刘德武;李耀坤

作者机构：

关键词： 山羊;卵巢基质;卵泡;转录组;高通量测序

期刊名称： 华南农业大学学报

ISSN： 1001-411X

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 23-32

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】比较山羊Capra hircus卵巢基质、大卵泡和小卵泡间的m RNA表达图谱,为探究卵泡发育机制提供一定的研究基础。【方法】采用高通量测序技术对发情期川中黑山羊的卵巢基质、大卵泡和小卵泡进行转录组测序,利用生物信息学方法检测mRNA表达谱,筛选差异基因,对其进行GO和KEGG通路分析,最后随机抽取5个差异基因进行荧光定量PCR验证。【结果】卵巢基质vs大卵泡、卵巢基质vs小卵泡和小卵泡vs大卵泡的差异表达基因分别为524、180和403个。筛选出INHA、TNFRSF19等15个与卵泡发育相关的基因,其主要富集在内质网蛋白质加工、类固醇生物合成、卵母细胞减数分裂等信号通路。通过q RT-PCR验证,定量结果与测序结果基本一致。【结论】川中黑山羊卵巢基质、大卵泡和小卵泡的基因表达模式不同,小卵泡与卵巢基质的基因表达模式更相近。

分类号： S827

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