油菜脂肪酸延长酶基因fae1片段的克隆与SNP分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 肖玲

作者： 肖玲;卢长明

作者机构：

关键词： 油菜;fae1;PCR;基因克隆;序列分析;芥酸

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2005 年 38 卷 05 期

页码： 891-896

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 脂肪酸延长酶基因fae1是调控油菜芥酸合成的关键基因。本研究利用GenBank中的fae1基因序列AF490462为模板设计引物,通过多聚酶链式反应(PCR)从白菜、甘蓝和甘蓝型油菜(包括2个人工合成种)的12个不同品种中扩增出长1007bp的fae1基因片段。PCR产物经与克隆载体pGEM-Tvector连接和序列测定,获得12个品种的fae1基因片段的DNA序列。对来自12个不同品种的fae1基因序列进行比较分析表明:fae1基因具有高度序列保守性,扩增长度均为1007bp,核苷酸序列相似度达98%以上,氨基酸序列的保守性更高。在1007bp的区间内共发现23个SNP(singlenucleotidepolymorphism)位点,其中有11个单核苷酸变异导致了编码氨基酸的改变。人工甘蓝型油菜和天然甘蓝型油菜的fae1基因片段未发现明显差异。发现了高芥酸品种与低芥酸品种的fae1基因、以及A基因组与C基因组的fae1基因特有SNP位点。

分类号： S565.4

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