巴西橡胶树PPCK基因家族成员的鉴定和表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 肖小虎
作者: 肖小虎;隋金蕾;戚继艳;阳江华;朱晋恒;唐朝荣
作者机构:
关键词: 巴西橡胶树;PPCK;基因家族;结构和进化;表达分析
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2016 年 37 卷 11 期
页码: 2164-2169
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以已发表的PPCK序列为探针,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的转录组和基因组进行全面搜索,鉴定得到17个PPCK基因,其中包括3个橡胶树PPCK基因,命名为Hb PPCK1-3。序列分析发现,Hb PPCK1-3和其他植物一样在结构上非常保守,只有一个内含子和一个蛋白激酶结构域,并且相对位置也比较一致。在进化上,橡胶树、木薯和蓖麻3种大戟科植物的PPCK蛋白具有较近的亲缘关系。Hb PPCK3在树皮中表达丰度最高,其次是种子和雄花;Hb PPCK2在胶乳和根中表达丰度相对较高,而Hb PPCK1在各组织中的表达都比较低。另外,大部分家族成员的表达都受到真菌侵染、低温和干旱胁迫处理的诱导,而乙烯利处理却能抑制Hb PPCK2的表达。
分类号: S794.1
- 相关文献
[1]巴西橡胶树膜联蛋白基因家族成员的鉴定和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,方永军,王闯,唐朝荣. 2016
[2]巴西橡胶树钙调蛋白基因的克隆和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,阳江华,秦云霞,唐朝荣. 2016
[3]巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,秦云霞,黄亚成,唐朝荣. 2016
[4]巴西橡胶树PEPRK基因家族成员的鉴定和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,方永军,周斌辉,唐朝荣. 2017
[5]橡胶树羟基腈水解酶基因的克隆、表达和基因家族分析. 吴坤鑫,谭德冠,张家明. 2016
[6]巴西橡胶树RALF基因家族的鉴定及其表达分析. 杨洪,王立丰,代龙军,赵溪竹. 2021
[7]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019
[8]基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析. 张小雪,韦晓霞,陈发兴. 2021
[9]甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析. 侯黔东,沈天娇,余欢欢,仇志浪,文壮,张惠敏,吴亚维,文晓鹏. 2021
[10]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[11]菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析. 阮城城,胡福初,罗志文,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,韩冰,陈哲,张治礼. 2020
[12]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016
[13]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017
[14]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023
[15]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022
[16]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018
[17]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019
[18]石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析. 骆翔,曹尚银,李好先,赵弟广,张富红,陈丽娜,Krishna Poudel,敬丹,唐丽颖. 2020
[19]荔枝GA2ox基因家族的鉴定及表达分析. 陈哲,王祥和,周文静,周瑞云,吴文碟,吴凤芝,范鸿雁,胡福初. 2021
[20]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021
作者其他论文 更多>>
-
橡胶树水通道蛋白HbPIP2;7的亚细胞定位与多聚化分析
作者:邹智;郑玉皎;乔雪莹;阳江华
关键词:橡胶树;乳管;水通道蛋白;亚细胞定位;双分子荧光互补;酵母双杂交
-
橡胶树HbPIP2;3的亚细胞定位与多聚化分析
作者:邹智;乔雪莹;郑玉皎;阳江华
关键词:乳管;水通道蛋白;亚细胞定位;双分子荧光互补;酵母双杂交
-
橡胶树HbACS2关键氨基酸位点的鉴定
作者:毛嘉诚;龙翔宇;曾力旺;阳江华;胡斌;方永军;郝园园;秦云霞
关键词:橡胶树;乙酰辅酶A合成酶;乙酸;乙酰辅酶A;乙酰化
-
橡胶树HbPIP1;1基因的克隆及蛋白的亚细胞定位与多聚化分析
作者:乔雪莹;郑玉皎;阳江华;曾长英;邹智
关键词:橡胶树;亚细胞定位;多聚化;双分子荧光互补;酵母双杂交
-
巴西橡胶树HbDBB家族基因的鉴定与表达分析
作者:张鸿韬;杨玉海;肖小虎;阳江华;秦云霞;龙翔宇;方永军
关键词:巴西橡胶树;DBB;转录因子;基因表达
-
巴西橡胶树胶乳中DUF1262结构域蛋白结构与基因表达分析
作者:代龙军;刘明洋;阳江华;周凯;郭冰冰;杨洪;王立丰
关键词:巴西橡胶树;DUF1262结构域;基因表达;天然橡胶合成
-
巴西橡胶树CAMTA转录因子全基因组鉴定与表达分析
作者:林显祖;肖小虎;阳江华;秦云霞;龙翔宇;方永军
关键词:巴西橡胶树;转录因子;CAMTA;基因表达
