百合LoXTH23基因克隆、生物信息学分析及在鳞茎休眠解除过程中的表达动态

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张济民

作者： 张济民;王浩;贾文杰;孙亮;张小平;王有国

作者机构：

关键词： 百合;LoXTH23;生物信息学分析;休眠解除

期刊名称： 云南农业大学学报

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2023 年 38 卷 011 期

页码： 1041-1048

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]研究西伯利亚百合(Lilium oriental'Siberia')休眠解除过程中LoXTH23基因的作用.[方法]以西伯利亚百合鳞茎为试验材料,从前期转录组测序结果中筛选出 1个休眠解除期差异显著的XTH家族基因,利用RT-PCR技术扩增该基因cDNA全长序列,命名为LoXTH23.采用生物信息学软件对LoXTH23基因结构、理化性质等进行分析;采用荧光定量PCR技术测定LoXTH23基因在鳞茎休眠解除过程中的相对表达量.[结果]LoXTH23基因开放阅读框全长 858 bp,编码 285个氨基酸,包含GH16结构域,属于XTH家族基因;编码的蛋白相对分子量约为 3.19 ku,理论等电点为 6.19,是存在跨膜结构域和信号肽的不稳定亲水蛋白;二级结构中以随机卷曲为主,存在 30个磷酸化位点;荧光定量PCR结果显示:LoXTH23基因的表达量在鳞茎休眠完全解除10d时最高.[结论]LoXTH23可能在百合鳞茎休眠解除调控进程中起重要作用.

分类号： S682.265.01

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