双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 施肖堃

作者： 施肖堃;卢园萍;蔡志欣;郭仲杰;陈美元;廖剑华

作者机构：

关键词： 双孢蘑菇;子实体发育;转录组测序;差异表达基因

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2019 年 007 期

页码： 775-781

收录情况： CSCD

摘要： [目的]通过多个双孢蘑菇菌株不同发育阶段的差异转录组分析,为进一步验证双孢蘑菇发育相关基因及探讨其分子机理奠定基础.[方法]对双孢蘑菇主栽品种As2796及其亲本02、8213,其回交子代W192,以及国外野生菌株ARP159、国内野生菌株AgLH830共6个具有重要代表性的菌株子实体原基期、幼菇期、采摘期、开伞期等4个不同发育阶段共24个样品进行转录组测序,并与双孢蘑菇参考基因组序列进行比对,根据比对结果进行各基因在不同样品中的表达量分析及差异表达基因识别,发掘新基因与共同基因的差异表达,并进行各数据库的基因功能注释.[结果]结果共鉴定到10 660个转录本,发掘新基因677个,其中237个得到功能注释.与原基期相比,6个菌株在幼菇期、采摘期和开伞期分别有49、82、73个共同差异表达基因,其中有13个是相同的基因.[结论]发现了一批在双孢蘑菇子实体不同发育阶段具有显著差异表达的基因,筛选出不同菌株不同阶段的共有差异基因,对双孢蘑菇子实体发育中重要的差异基因进行了注释与探讨.

分类号： S646.11

  • 相关文献

[1]双孢蘑菇As2796子实体发育转录组测序分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华,王泽生. 2018

[2]双孢蘑菇As2796菌株气生与贴生菌丝遗传差异的转录组分析. 戴建清,陈文智,曾志恒,蔡志欣,陈美元. 2024

[3]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018

[4]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020

[5]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[6]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021

[7]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021

[8]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023

[9]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[10]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019

[11]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015

[12]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023

[13]不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析. 李月,王云龙,欧阳珑玲. 2022

[14]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022

[15]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017

[16]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024

[17]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019

[18]红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析. 李荣妮,王赛赛,田仲,孙砚胜,张博,张欣. 2022

[19]基于转录组测序的金银花提取物抗鸽源新城疫病毒感染的作用机制研究. 莫红芳,石宗承,杨燕燕,俸云,虞霖田,石德顺,熊晓妍. 2024

[20]西方蜜蜂工蜂不同虫态发育的转录组学分析. 宋文菲,胡宗文,苗春辉,余玉生,杨爽,李亚辉. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序