2011-2012年我国部分地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 郭容利
作者: 郭容利;何孔旺;茅爱华;刘浩飞;俞正玉;倪艳秀;温立斌;李彬;王小敏;张雪寒;吕立新;周俊明
作者机构:
关键词: 猪流行性腹泻病毒(PEDV);ORF3基因;遗传变异
期刊名称: 畜牧与兽医
ISSN: 0529-5130
年卷期: 2013 年 45 卷 005 期
页码: 1-4
收录情况: 北大核心
摘要: 应用RT-PCR方法对江苏、安徽、山东、江西、河北、上海、北京等省市的146份腹泻仔猪的小肠组织和粪便样本进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测.结果:146份腹泻病料中共检出82份PEDV阳性样品,阳性率为56.2%;对其中14份阳性病料的ORF3基因进行测序,将所测序列与GenBank中PEDV参考毒株的ORF3序列进行分析比较,并绘制了系统进化树.所测14个PEDV ORF3序列与GenBank中的38个参考毒株ORF3核苷酸序列同源性为93%~100%;ORF3基因系统进化树分析表明PEDV分为3组,13个病毒属于PEDV 3组,另外1个属于PEDV 1组.ORF3遗传变异分析表明:中国最近流行的PEDV野毒株与韩国野毒株关系密切,但与欧洲株以及中国目前使用的疫苗株基因差异较大.
分类号: S852.65
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