利用SSR标记构建板栗初级核心种质

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张馨方

作者： 张馨方;张树航;李颖;郭燕;王广鹏

作者机构：

关键词： 板栗;初级核心种质;SSR;遗传多样性

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 89-101

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为科学利用现有板栗种质资源并对其进行高效管理和保存。本研究利用简单重复序列（SSR）标记,采用非加权算数平均聚类法（UPGMA）对来自12个省（市或自治区）的279份板栗种质进行多次聚类抽样。聚类抽样时将2种遗传相似系数（SM系数和Dice系数）和2种取样方法（随机取样法和位点优先取样法）分别组合获得不同样本群,再比较不同样本群的有效等位基因数（Ne）、Nei’s多样性指数（H）和Shannon’s信息指数（I）,研究构建板栗初级核心种质的适宜方法,并采用t检验和主坐标分析评价初级核心种质的代表性,结合表型特征对其进行确认。结果表明:应用位点优先取样法取得的种质比随机取样法具有更高的Ne、H和I;应用SM相似性系数构建的核心样本,其遗传多样性指标要优于Dice相似性系数;根据主坐标结合形态学指标分析,利用位点优先取样法和SM相似性系数经过3次聚类构建了68份板栗初级核心种质,保留了原种质24.37%的样品,Ne、H和I分别为1.539、0.329和0.502,均高于原种质各遗传多样性指标,能够较全面的代表整个板栗资源的遗传多样性。综上,基于SSR标记利用SM系数聚类,并结合位点优先取样法是构建板栗初级核心种质较适宜的方法。

分类号： S664.2

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