冷胁迫下果蔗叶片转录组分析及茉莉酸信号传导基因挖掘
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈明辉
作者: 陈明辉;徐豫;黄志强;王俊青;张保青
作者机构:
关键词: 果蔗;转录组测序;冷胁迫;茉莉酸代谢途径
期刊名称: 作物杂志
ISSN: 1001-7283
年卷期: 2025 年 004 期
页码: 95-103
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 探讨冷胁迫(0℃)条件下果蔗基因表达谱的变化,为果蔗抗寒育种、引种及栽培提供理论依据。采用高通量测序平台对对照组(25℃)和冷胁迫处理组(0℃)条件下果蔗进行转录组测序。对测序数据进行分析,筛选响应冷胁迫的茉莉酸代谢途径关键基因,对鉴定出的重要基因进行表达量的qRT-PCR验证。结果表明,低温胁迫处理后,2组样品通过筛选共获得321个差异表达基因(DEGs),其中167个基因上调,154个基因下调。GO功能富集分析显示,DEGs显著富集于催化活性、结合、代谢过程、细胞过程和细胞器等条目。KEGG途径富集分析发现,角质和木栓质合成、光合作用、脂肪酸代谢、淀粉和蔗糖代谢以及植物激素信号转导等为果蔗响应冷胁迫的重要代谢通路。qRT-PCR分析表明,冷胁迫后果蔗茉莉酸代谢途径相关基因SoPYL1、SoOPCL1、SoAOC1、SoLOX3、SoAOS1和SoMYC2均上调表达,该结果与转录组测序变化趋势相似,同时进一步证实了RNA-seq数据的准确性。
分类号: S566.1
- 相关文献
[1]东乡野生稻根系抗氧化系统对冷胁迫的反应. 张成良,杨军,陈大洲,肖叶青. 2009
[2]东乡野生稻耐冷片断导入系基因表达谱的比较分析. 陈明亮,章禄标,胡兰香,吴小燕,陈红萍,肖叶青. 2016
[3]萎锈灵杀菌剂对提高棉花耐低温冷害胁迫能力的影响. 周小云,李进,张军高,刘梦丽,甘恩祥,翟梦华,王莉,杜鹏程,梁晶,雷斌. 2020
[4]花生生长素抑制蛋白AhARP1的克隆与表达分析. 于树涛,吴金桐,孙泓希,任亮,于洪波. 2016
[5]冷胁迫下甘蓝型冬油菜表达蛋白及BnGSTs基因家族的鉴定与分析. 马骊,白静,赵玉红,孙柏林,侯献飞,方彦,王旺田,蒲媛媛,刘丽君,徐佳,陶肖蕾,孙万仓,武军艳. 2023
[6]水稻ES1参与生物钟基因表达调控以及逆境胁迫响应. 徐江民,姜洪真,林晗,黄苗苗,符巧丽,曾大力,饶玉春. 2016
[7]二倍体与三倍体香蕉苗对冷胁迫的生理响应. 韦绍龙,孙嘉曼,田丹丹,周维,韦弟. 2014
[8]苹果矮化砧‘71-3-150’对冷胁迫的生理与转录组响应. 王海波,程来亮,常源升,孙清荣,陶吉寒,李林光. 2016
[9]苹果矮化砧'71-3-150'对冷胁迫的生理与转录组响应. 王海波,程来亮,常源升,孙清荣,陶吉寒,李林光. 2016
[10]LsICE1基因表达及调控转基因水稻抗冷通路研究. 向殿军,满丽莉,张娣,王丽娜,殷奎德,宋群雁,徐正进. 2013
[11]拟南芥CBF冷反应通路. 杨家森,张洪涛,李新国,毕玉平. 2006
[12]冷胁迫条件下东乡野生稻中高表达基因位点BGIOSGA004402的氨基酸序列分析. 李丁,夏玉梅,方真,唐宁,李祺,曹孟良. 2015
[13]谷子育成品种萌芽期耐冷性综合评价. 闫锋,董扬,李清泉,赵富阳,侯晓敏,刘洋,李青超,赵蕾,范国权,刘凯. 2024
[14]冷胁迫条件下拟南芥Rubisco相互作用蛋白质的比较分析(英文). 安佰义,刘小雨,谭化,林卫红,孙立文. 2011
[15]冷胁迫下黄瓜幼苗叶片内膜系统反应动态. 王毅,方秀娟,付宏兰,马淑芳. 1996
[16]蓖麻SnRK2基因家族的鉴定和特征分析. 敖涛,胡尊红,和珊,胡学礼,刘旭云,刘爱忠. 2015
[17]花生AhFAD2-1基因启动子及5'-UTR内含子功能验证及其低温胁迫应答. 石磊,苗利娟,黄冰艳,高伟,张忠信,齐飞艳,刘娟,董文召,张新友. 2021
[18]BcICE1基因表达模式及调控转基因水稻抗冷通路研究. 向殿军,满丽莉,王丽娜,张娣,殷奎德,宋群雁,徐正进. 2013
[19]核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析. 刘凯,李瑶玲,李洋,王红霞,赵书岗,安秀红,张志华. 2022
[20]降低营养液Mn~(2+)·Cu~(2+)和Zn~(2+)浓度对冷胁迫嫁接黄瓜幼苗叶片SOD活性的影响(英文). 李涛,高俊杰,于贤昌. 2011
作者其他论文 更多>>
-
57NG208与南涧果蔗正反交后代的抗倒伏性评价
作者:俞华先;安汝东;桃联安;经艳芬;郎荣斌;边芯;张钰;刘新龙;刘家勇;赵丽萍;刘洪博;张革民;张保青
关键词:大茎野生种;南涧果蔗;抗倒伏;农艺性状
-
广西河八王种质资源考察收集与鉴定评价
作者:宗文一;张保青;张革民;黄玉新;杨翠芳;周珊;高轶静;熊发前;刘菁;陆衫羽;杨细平;段维兴
关键词:河八王;甘蔗;种质资源;表型性状;鉴定评价;遗传多样性
-
湖羊TMEM18基因的组织表达及其多态性与饲料转化率的关联分析
作者:刘晓强;李成海;王维民;高飞;田慧彬;王立忠;赵源;马宗武;黄志强;蔡有鑫;张小雪
关键词:跨膜蛋白18(TMEM18)基因;饲料转化率;湖羊;SNPs
-
甘蔗遗传连锁图谱构建及QTL定位研究进展
作者:黄玉新;张保青;杨翠芳;周珊;段维兴;张革民;周会;陆衫羽;黄赞斌;李明伦;高轶静
关键词:甘蔗;遗传连锁图谱;QTL定位;标记辅助选择育种
-
光周期诱导起始时间对桂糖系列甘蔗亲本开花习性的影响
作者:高丽花;李明伦;经艳;庞家本;林秋妹;张小秋;宋修鹏;张保青;周会;雷敬超
关键词:甘蔗;亲本;桂糖系列;光周期诱导;开花
-
大茎野生种正反交后代的蔗茎纤维组分和力学性能差异分析
作者:俞华先;赵培方;安汝东;董立华;桃联安;经艳芬;郎荣斌;边芯;张钰;张革民;张保青;杨翠芳
关键词:甘蔗;大茎野生种;南涧果蔗;纤维组分;折断力
-
甘蔗适度规模经营调研分析
作者:李心怡;赖振光;黄东亮;王维赞;邓智年;邓宇驰;张保青;李毅杰;徐林;庞天;高轶静;何有良;吴建明
关键词:甘蔗;广西;丘陵山地;土地规模经营;适度规模经营
