基因II型猫杯状病毒XA20-2023株的分离鉴定及基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谈晓梅

作者： 谈晓梅;张琦;张树梅;朱旭;董宁宁;李娜;刘光清;徐彦召;孟春春

作者机构：

关键词： 猫杯状病毒;分离鉴定;全基因组序列;序列分析

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2024 年 46 卷 007 期

页码： 754-760

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解猫杯状病毒(FCV)的生物学特性及遗传规律,本研究对从陕西西安地区采集的17份疑似FCV感染的口鼻咽样品经PCR检测,并经PCR扩增FCV阳性样品的VP1基因并测序.采用SnapGene软件分析GenBank中国内外23株FCV参考株与所测VP1的氨基酸序列,结果显示,17份拭子样品中有6份呈FCV阳性,阳性率为35.3%.氨基酸序列分析结果显示,所测VP1序列中有一条与GII型FCV VP1氨基酸序列存在3处相同的变异,分别为N377K、A539V、G557S,其余5条VP1氨基酸序列的变异与GI型FCV的VP1一致.表明所测VP1基因序列对应的FCV属于GII型.将该FCV阳性样品接种CRFK细胞进行病毒的分离与传代,并在传代过程中观察细胞的CPE.将传至5代的病毒分别采用PCR与间接免疫荧光试验(IFA)鉴定,结果显示连续传5代后,每代CRFK细胞均产生稳定且典型的CPE,并能观察到FCV的特异性绿色荧光,表明分离到一株GII型FCV并命名为XA20-2023株.经PCR分段扩增第5代分离病毒的全基因组序列,测序拼接后显示XA20-2023株全长7 687 bp.采用MegAlign软件分析该株病毒与GenBank中10株FCV的全基因组、非结构蛋白、VP1及VP2编码基因序列的同源性.采用MEGA 11软件中的NJ法构建XA20-2023株与GenBank中85株FCV参考株全基因组序列的系统发育树.同源性分析结果显示,XA20-2023株与GenBank中10株FCV全基因组序列的同源性为76.4%~84.2%,与GII型FCV SH株全基因组序列的同源性最高为84.2%,与GI型疫苗株F9、F4及FCV 255株全基因组序列的同源性分别为76.4%、77%及77.1%.非结构蛋白编码基因序列的同源性差异最大的是NS2(74.6%~94.2%),差异最小的是NS6(77.3%~82.9%).VP1及VP2编码基因序列的同源性分别为73.7%~83.8%及76.0%~87.5%.进化树结果显示XA20-2023株与GII型分离株处于同一分支,与GI型疫苗株F9和F4的遗传距离较远.上述结果进一步表明,XA20-2023株为GII型FCV,与FCV代表株尤其是GI型疫苗株的同源性较低,且其变异程度较高.本研究丰富了西安地区流行的GII型FCV基因库,并为后续揭示国内GII型FCV的流行状况、遗传变异及其所致疫病的防制具有重要意义.

分类号： S852.65

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