鼠隐藏管状线虫烯醇化酶基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈宁

作者： 陈宁;王平;程田;龚振兴;谢天柱;李俊鹏;张延忠;王晓炜;鲁艺

作者机构：

关键词： 鼠隐藏管状线虫;烯醇化酶;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2017 年 25 卷 01 期

页码： 50-58

收录情况： 北大核心

摘要： 为获得鼠隐藏管状线虫(Syphacia obvelata)烯醇化酶结构及其功能,采用同源克隆方法结合RACE技术克隆获得了烯醇化酶基因c DNA序列,并对其进行了序列分析。测序结果显示,扩增获得的鼠隐藏管状线虫烯醇化酶基因大小序列为1603 bp,包含全长为1311 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)序列,共编码436个氨基酸,推导分子量为47.428 k Da。序列分析结果显示,鼠隐藏管状线虫烯醇化酶含有10个丝氨酸激酶磷酸化位点、3个苏氨酸激酶磷酸化位点和4个酪氨酸激酶磷酸化位点,1个潜在的跨膜螺旋结构,无信号肽剪切位点;在亚细胞水平,预测其主要定位于胞浆;二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,其中α-螺旋占34.86%,无规则卷曲占30.50%,延伸链占24.08%,β-转角占10.55%。Swiss-Model模建的3D结构显示,鼠隐藏管状线虫烯醇化酶为一"哑铃"样结构,包含氨基端和羧基端两个结构域,结构域之间为Linker区。每个结构域由多个α-螺旋、β-折叠和卷曲所构成桶形结构,催化中心和Mg~(2+)结合位点位于桶形结构的中心。本研究结果为鼠隐藏管状线虫烯醇化酶基因的功能研究奠定基础。

分类号： Q78`S852.7

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