辣椒种质资源ITS与系统进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐小万

作者： 徐小万;李颖;王恒明;徐晓美;李涛;罗少波

作者机构：

关键词： 辣椒;ITS序列;系统进化

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2014 年 41 卷 05 期

页码： 881-888

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以核糖体DNA内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,rDNA ITS区)作为DNA条形码对辣椒进行系统进化分析。利用收集的17份辣椒资源,提取总DNA,进行PCR扩增和测序,并从GenBank下载辣椒属的主要栽培种浆果状椒(Capsicum baccatum)、茸毛椒(C.pubescens)、灌木状辣椒(C.frutescens)和野生种(C.eximium)、野生种(C.lycianthoides)的ITS序列,进行系统进化与亲缘关系分析。结果表明,以野生种(C.eximium)的ITS序列为参考序列,利用Clustalx 2.1软件进行比对,发现3个中华辣椒、茸毛椒和灌木状辣椒在ITS1区有15个碱基缺失。以茄科番茄属(lycopersicon)栽培种‘上海906’作为外类群,在进化树标尺约0.11处,22个辣椒属ITS序列可分为6个分支。全部一年生辣椒(14个)聚在一支。中华辣椒(3个)和灌木状辣椒聚在一支,表明中华辣椒与灌木状辣椒亲缘关系相对较近。野生种(C.eximium)、浆果状椒、茸毛椒和野生种(C.lycianthoides)分别单独为一支。

分类号： S641.3

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